Webový nástroj pro rychlou genotypizaci bakteriálních kmenů

Simple item page
but.committeeprof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (předseda) Ing. Markéta Jakubíčková, Ph.D. (místopředseda) Ing. Radovan Smíšek, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (člen) Ing. Martin Králík (člen) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Dr. Nykrýnová se zeptala na případ kdy je ve FASTA souboru více sekvencí. Dodá nástroj informaci o pozici alely (plasmid, chromosom)? Ing. Králík se dotázal na momentální stav webové aplikace, kde aplikace běží? Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorVítková, Helenacs
dc.contributor.authorKaňoková, Martinacs
dc.contributor.refereeJakubíčková, Markétacs
dc.date.created2024cs
dc.description.abstractTato práce se zabývá tvorbou algoritmu pro detekci zvolených genů rezistence a virulence. První část představuje genotypizační metody, zmiňuje jejich využití spolu s výhodami a nevýhodami. V další části jsou představeny některé z bioinformatických nástrojů, které lze pro genotypizaci použít. Praktická část pak tyto nástroje využívá. Dále je v praktické části představena vlastní webová aplikace umožňující určení sekvenčního typu spolu s detekcí genů virulence a rezistence v bakteriálním genomu.cs
dc.description.abstractThis thesis is focused on creating algorithm for detection of chosen resistance and viru- lence genes. First part introduces genotyping methods and mentions their use, pros and cons. In the next part, some of bioinformatics tools that can be used for genotyping are presented. The practical part then uses these tools. Practical part is also focused on creating new web application capable of detecting virulence and resistance genes in bacteria as well as determining the sequence type.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationKAŇOKOVÁ, M. Webový nástroj pro rychlou genotypizaci bakteriálních kmenů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024.cs
dc.identifier.other159697cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/246786
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjecttypizace bakteriícs
dc.subjectMLSTcs
dc.subjectgenotypizacecs
dc.subjectwebový nástroj pro genotypizacics
dc.subjectbacterial typingen
dc.subjectMLSTen
dc.subjectgenotypingen
dc.subjectweb-based genotyping toolen
dc.titleWebový nástroj pro rychlou genotypizaci bakteriálních kmenůcs
dc.title.alternativeWeb-based tool for fast bacterial genotypingen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2024-06-11cs
dcterms.modified2024-06-12-15:39:12cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid159697en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.17 17:19:56en
sync.item.modts2025.01.15 23:29:47en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
5.52 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
150.98 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_159697.html
Size:
6.05 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_159697.html
Download
Collections
2024