Nástroj pro zpracování a konverzi nanopórových signálů

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Martin Augustynek, Ph.D. (předseda) Ing. Martin Mézl, Ph.D. (místopředseda) Ing. Kateřina Šabatová (člen) Ing. Martin Vítek, Ph.D. (člen) MUDr. Tibor Stračina, Ph.D. (člen) Ing. Petra Novotná (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Dr. Mézl se zeptal na srovnání studentova nástroje s dostupnými softwarovými řešeními. Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykslovenština (Slovak)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJakubíčková, Markétask
dc.contributor.authorSuriak, Martinsk
dc.contributor.refereeŠabatová, Kateřinask
dc.date.created2024cs
dc.description.abstractTáto bakalárska práca je venovaná návrhu nástroja pre spracovanie a konverziu nanopórových signálov. V úvode čitateľovi objasňuje vývoj sekvenačných technológií, následne približuje formáty dát obsahujúce informácie vzniknuté nanopórovým sekvenovaním a nakoniec zoznamuje čitateľa s konverziou signálu na nukleotidovú sekvenciu procesom zvaným basecalling. Praktická časť je venovaná implementácii nástroja schopného vyhľadávania zvolenej nukleotidovej sekvencie vo vytvorených čítaniach, exportu vybraných dát sekvenačného behu v podobe súborov vhodného formátu a vizualizácie signálu so zvýraznenými pozíciami nukleotidov.sk
dc.description.abstractThis bachelor thesis focuses on the development of a tool for processing and converting nanopore signals. It starts by explaining the development of sequencing technologies, then introduces data formats containing information generated by nanopore sequencing, and finally introduces the reader to the conversion of a signal to a nucleotide sequence by a process called basecalling. The practical part addresses the implementation of a tool capable of searching for a selected nucleotide sequence in the generated reads, the export of selected sequencing run data as files of appropriate format, and the visualization of a signal of a selected read with the nucleotide positions highlighted.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationSURIAK, M. Nástroj pro zpracování a konverzi nanopórových signálů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024.cs
dc.identifier.other159725cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/247406
dc.language.isoskcs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectnanopórová sekvenáciask
dc.subjectbasecallingsk
dc.subjectnukleotidová sekvenciask
dc.subjectDNAsk
dc.subjectdátový formátsk
dc.subjectnanopore sequencingen
dc.subjectbasecallingen
dc.subjectnucleotide sequenceen
dc.subjectDNAen
dc.subjectdata formaten
dc.titleNástroj pro zpracování a konverzi nanopórových signálůsk
dc.title.alternativeTool for processing and converting nanopore signalsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2024-06-12cs
dcterms.modified2024-06-12-15:39:14cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid159725en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.17 17:22:20en
sync.item.modts2025.01.17 10:39:26en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
5.61 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
31.02 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_159725.html
Size:
4.86 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_159725.html
Download
Collections
2024