Simulátor čtení pro bakteriální RNA-Seq

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Marek Penhaker, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen) Ing. Kateřina Šabatová (člen) MUDr. Tibor Stračina, Ph.D. (člen) Mgr. Veronika Bulková, Ph.D., MHA. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Penhaker položil otázku, jakým způsobem by se dalo zbavit senzitivity bakterie pomocí DNA úpravy? Doc. Kolářová položila otázku týkající se zápisu FASTQ skóre. Studentka obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelcs
dc.contributor.authorFialová, Adélacs
dc.contributor.refereeŠabatová, Kateřinacs
dc.date.created2024cs
dc.description.abstractTato práce se zaměřuje na analýzu bakteriálního genomu, měření jeho exprese především prostřednictvím technologie RNA-Seq a na simulaci RNA-Seq dat. První část práce poskytuje teoretický základ o struktuře bakteriálního genomu, jeho expresi a metodách jejího studia, včetně moderních sekvenačních technik. Pozornost je věnována i několika vybraným simulátorům RNA-Seq dat. V druhé části je představena vlastní implementace simulátoru, navržená pro zohlednění charakteristik bakteriálního genomu, zejména přítomnosti operonů.cs
dc.description.abstractThis thesis is dedicated to the analysis of the bacterial genome, measurement of its expression mainly by RNA-Seq technology and simulation of RNA-Seq data. The first part of the thesis provides a theoretical background on the structure of the bacterial genome, its expression and methods to study it, including modern sequencing techniques. Several selected simulators of RNA-Seq data are also mentioned. In the second part, the actual simulator implementation is presented, designed to take into account the characteristics of the bacterial genome, in particular the presence of operons.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationFIALOVÁ, A. Simulátor čtení pro bakteriální RNA-Seq [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024.cs
dc.identifier.other159688cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/246781
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectRNA-Seqcs
dc.subjectRNAcs
dc.subjectsimulacecs
dc.subjectsekvenovánícs
dc.subjectbakteriecs
dc.subjectgenová expresecs
dc.subjectRNA-Seqen
dc.subjectRNAen
dc.subjectsimulationen
dc.subjectsequencingen
dc.subjectbacteriaen
dc.subjectgene expressionen
dc.titleSimulátor čtení pro bakteriální RNA-Seqcs
dc.title.alternativeRead simulator for bacterial RNA-Seqen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2024-06-11cs
dcterms.modified2024-06-12-15:39:11cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid159688en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.17 17:19:52en
sync.item.modts2025.01.16 00:19:12en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
6.67 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
181.88 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_159688.html
Size:
5.73 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_159688.html
Download
Collections
2024