Predikce malých RNA u vybraných bakteriálních producentů bioplastů
| but.committee | prof. Pharm.Dr. Petr Babula, Ph.D. (předseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (místopředseda) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen) Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Babula okomentoval růstové křivky. Dr. Čejková se zeptala na further analysis. Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta. | cs |
| but.jazyk | angličtina (English) | |
| but.program | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Sedlář, Karel | en |
| dc.contributor.author | Heřmánková, Kristýna | en |
| dc.contributor.referee | Vítková, Helena | en |
| dc.date.created | 2024 | cs |
| dc.description.abstract | Využití bakterií v biotechnologii vyžaduje důkladné pochopení schopností použitých bakterií pro maximalizaci výtěžku. To platí například pro výrobu bioplastů, kde konkurenceschopnost s levnějšími plasty na bázi fosilních paliv závisí také na ceně procesu pro získání požadovaného výtěžku. Nahlédnutí do regulačních mechanismů bakterií, jako je regulace pomocí malých RNA, která zajišťuje rychlou reakci především na stresové podmínky, může pomoct odhalit jejich vlastnosti a posoudit tak jejich využitelnost v biotechnologiích. Tato diplomová práce se zabývá zpracováním bakteriálních transkriptomických dat, které byly sekvenovány pomocí RNA-Seq. Práce je zaměřena zejména na predikci malých RNA u poskytnuté bakterie, slibného kandidáta pro využití v biotechnologii. Cílem je získat přehled o malých RNA v této bakterii, zejména analyzovat potenciální regulaci syntézy PHA malými RNA, které by mohly rozšířit přehled o využitelnosti bakterie pro produkci PHA. | en |
| dc.description.abstract | The utilization of bacteria in biotechnology requires a thorough understanding of the capabilities of the bacteria used to maximise the yield. This is applicable, for example, in the production of bioplastics, where competitiveness with cheaper fossil fuel-based plastics depends also on the price of the process to obtain the desired yield. The insight into regulatory mechanisms of bacteria, such as regulation by small RNAs, which ensures a rapid response to stress conditions in particular, can reveal their characteristics and thus assess their use in biotechnology. This thesis deals with bacterial transcriptomic data sequenced with RNA-Seq. Especially, work is focused on the prediction of small RNAs in provided bacterium, a promising candidate for use in biotechnology. The aim is to gain insight into the regulation by sRNAs in this bacterium, in order to analyze the potential regulation of PHA synthesis by small RNAs, which could expand the insight into the utility of the bacterium for PHA production. | cs |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | HEŘMÁNKOVÁ, K. Predikce malých RNA u vybraných bakteriálních producentů bioplastů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024. | cs |
| dc.identifier.other | 159751 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/246219 | |
| dc.language.iso | en | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | malé RNA | en |
| dc.subject | polyhydroxyalkanoáty | en |
| dc.subject | RNA-Seq | en |
| dc.subject | ko-expresní analýza | en |
| dc.subject | analýza diferenciální exprese | en |
| dc.subject | small RNA | cs |
| dc.subject | polyhydroxyalkanoates | cs |
| dc.subject | RNA-Seq | cs |
| dc.subject | co-expression analysis | cs |
| dc.subject | differential expression analysis | cs |
| dc.title | Predikce malých RNA u vybraných bakteriálních producentů bioplastů | en |
| dc.title.alternative | Prediction of small RNAs in selected bacterial producers of bioplastics | cs |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2024-06-10 | cs |
| dcterms.modified | 2024-06-11-09:05:48 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 159751 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 14:42:21 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.17 13:24:49 | en |
| thesis.discipline | bez specializace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |
Files
Original bundle
1 - 3 of 3
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 6.12 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- file final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- appendix-1.zip
- Size:
- 3.94 MB
- Format:
- Unknown data format
- Description:
- file appendix-1.zip
Loading...
- Name:
- review_159751.html
- Size:
- 5.99 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_159751.html