Profilování bakteriálního metylomu pomocí nanoporového sekvenování
| but.committee | doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (předseda) Ing. Jiří Chmelík, Ph.D. (místopředseda) Ing. Martin Králík (člen) Ing. Markéta Jakubíčková, Ph.D. (člen) MUDr.Ing. Richard Ředina (člen) | cs |
| but.defence | Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Sedlář položil otázku: Jak je možné porovnat výstupní heatmapy jinak než vizuálně? Jakou metriku byste využil? Který korelační koeficient byste použil? Ing. Chmelík položil otázku: Vysvětlete, proč byla instalace Python knihoven a dalších nástrojů časově náročná? Proč postup instalace není přiložen k práci? Jak dlouho trval výpočet výsledků a na jakých strojích jste výpočet prováděl? Ing. Jakubíčková položila otázku: Prováděl jste výpočty na grafické kartě? Proč jste pro sestavování genomu zvolil nástroj unicycler? Jaké byly výstupy po sestavení genomu? Kolik kontigů jste získal? Byly kruhové? Detekoval jste geny virulence a rezistence na chromozomu nebo na plazmidech? Jak jste prováděl filtrování čtení? Komise se usnesla, že praktická část není dostatečně splněna. Student tedy neobhájil diplomovou práci. | cs |
| but.jazyk | slovenština (Slovak) | |
| but.program | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| but.result | práce nebyla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Vítková, Helena | sk |
| dc.contributor.author | Tesák, Filip | sk |
| dc.contributor.referee | Musilová, Jana | sk |
| dc.date.created | 2024 | cs |
| dc.description.abstract | Metylácia DNA je jednou z najčastejšie pozorovaných epigenetických modifikácií. Vyskytuje sa u eukaryotov a prokaryotov a súvisí s mnohými epigenetickými procesmi. Takýmito procesmi môžu byť napríklad antibiotická rezistencia a virulencia vyskytujúce sa v celej rade bakteriálnych kmeňov, vrátane kmeňov označovaných ako patogénne. Rozšírené používanie technológií sekvenovania tretej generácie umožňuje priamu detekciu metylačných profilov v celom genóme, čo ponúka čoraz väčšie možnosti na pochopenie a potlačenie týchto epigenomických mechanizmov. | sk |
| dc.description.abstract | DNA methylation is one of the most frequently observed epigenetic modifications. It occurs in both eukaryotes and prokaryotes and is associated with many epigenetic processes. Such processes can include antibiotic resistance and virulence found in a wide range of bacterial strains, including those classified as pathogenic. The widespread use of third-generation sequencing technologies enables the direct detection of methylation profiles across the entire genome, offering increasing opportunities to understand and suppress these epigenomic mechanisms. | en |
| dc.description.mark | F | cs |
| dc.identifier.citation | TESÁK, F. Profilování bakteriálního metylomu pomocí nanoporového sekvenování [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024. | cs |
| dc.identifier.other | 159767 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/249580 | |
| dc.language.iso | sk | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | epigenetika | sk |
| dc.subject | bakteriálny genóm | sk |
| dc.subject | metylácia | sk |
| dc.subject | rezistencia | sk |
| dc.subject | virulencia | sk |
| dc.subject | epigenetics | en |
| dc.subject | bacterial genome | en |
| dc.subject | methylation | en |
| dc.subject | resistance | en |
| dc.subject | virulence | en |
| dc.title | Profilování bakteriálního metylomu pomocí nanoporového sekvenování | sk |
| dc.title.alternative | Bacterial methylome profiling by nanopore sequencing | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2024-08-29 | cs |
| dcterms.modified | 2024-08-29-10:11:22 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 159767 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 14:42:30 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 23:45:00 | en |
| thesis.discipline | bez specializace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |