Profilování bakteriálního metylomu pomocí nanoporového sekvenování

Abstract

Metylácia DNA je jednou z najčastejšie pozorovaných epigenetických modifikácií. Vyskytuje sa u eukaryotov a prokaryotov a súvisí s mnohými epigenetickými procesmi. Takýmito procesmi môžu byť napríklad antibiotická rezistencia a virulencia vyskytujúce sa v celej rade bakteriálnych kmeňov, vrátane kmeňov označovaných ako patogénne. Rozšírené používanie technológií sekvenovania tretej generácie umožňuje priamu detekciu metylačných profilov v celom genóme, čo ponúka čoraz väčšie možnosti na pochopenie a potlačenie týchto epigenomických mechanizmov.DNA methylation is one of the most frequently observed epigenetic modifications. It occurs in both eukaryotes and prokaryotes and is associated with many epigenetic processes. Such processes can include antibiotic resistance and virulence found in a wide range of bacterial strains, including those classified as pathogenic. The widespread use of third-generation sequencing technologies enables the direct detection of methylation profiles across the entire genome, offering increasing opportunities to understand and suppress these epigenomic mechanisms.