Metody pro vylepšení genomového sestavení založené na signálovém zpracování

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. RNDr. Martin Kovár, Ph.D. (místopředseda) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Odstrčilík položil otázku: k čemu se zde používá greedy algoritmus? Proč jste zvolil tento algoritmus? Uvažoval jste nad použitím jiného algoritmu? Jak dlouho trvá váš výpočet? Prof. Provazník položil otázku: jaká byla délka sekvencí? Jaký je překryv sekvencí na příkladu uvedeném v prezentaci? Doc. Kovár položil otázku: jsou založeny nějaké metriky na fázové reprezentaci genomu? Student obhájil diplomovou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelcs
dc.contributor.authorJugas, Robincs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2016cs
dc.description.abstractDiplomová práce se zabývá sekvenačními metodami a metodami sestavení genomu s využitím numerických reprezentací. Teoretická část práce popisuje historii objevu DNA, jednotlivé generace sekvenačních metod, samotné metody sestavení genomu a definici numerických reprezentací. Numerické reprezentace slouží pro převod znakové podoby DNA do numerické podoby a umožňují tak využití metod digitálního zpracování signálu. V práci je navržen algoritmus pro sestavení genomu s využitím numerické reprezentace, který je dále otestován na datech sekvencí.cs
dc.description.abstractThe diploma thesis deals with sequencing methods and genome assembly methods including usage of numerical representations. The theoretical part of thesis describes the history of DNA research, generations of sequencing methods, the assembly methods themselves and definiton of numerical representations. Numerical represenatations serve to convert character form of DNA to numerical form and so allow to use digital signal processing methods. There is an algorithm for genome assembly using numerical represenatation proposed in thesis, which is later tested at sequence data.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationJUGAS, R. Metody pro vylepšení genomového sestavení založené na signálovém zpracování [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2016.cs
dc.identifier.other93530cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/58957
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectsestavení genomucs
dc.subjectsekvenacecs
dc.subjectnumerické reprezentacecs
dc.subjectneúplná genomová sestavenícs
dc.subjectbioinformaticsen
dc.subjectDNAen
dc.subjectgenome assemblyen
dc.subjectsequencingen
dc.subjectnumerical representationsen
dc.subjectdraft assemblyen
dc.titleMetody pro vylepšení genomového sestavení založené na signálovém zpracovánícs
dc.title.alternativeSignal processing based methods for genome assembly refinementen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2016-06-08cs
dcterms.modified2016-06-10-12:57:28cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid93530en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:22:20en
sync.item.modts2025.01.15 17:35:58en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.1 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
5.96 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_93530.html
Size:
5.42 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_93530.html
Download
Collections
2016