Zpracování a analýza lidského střevního mikrobiomu ze sekvenačních dat 16S rDNA

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jiří Hozman, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda) prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen) Ing. Kateřina Šabatová (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Hozman položil otázku: Jak byste shrnula přínos Vaší práce? Jak se dá ověřit váš výsledek? Ing. Jurečková položila otázku: Jaká byla zpětná vazba na Vaše výsledky s FN Brno? Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJakubíčková, Markétacs
dc.contributor.authorZbudilová, Michaelacs
dc.contributor.refereeŠabatová, Kateřinacs
dc.date.created2023cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá analýzou lidského střevního mikrobiomu z dat ze 16S rRNA. V první části je teoreticky popsán střevní mikrobiom, způsoby jeho zpracování a vyhodnocení pomocí analýzy taxonomických jednotek a diverzity mikrobiomu. Další část je zaměřena na data, která jsou v práci zpracována a na formát, v jakém jsou tyto data poskytnuta. V třetí části je popsán navržený algoritmus sloužící ke zpracování dat a zároveň jsou i vyhodnoceny výsledky získané spuštěním právě tohoto algoritmu. V další části práce jsou vzorky z Fakultní nemocnice Brno zpracovány pomocí navrženého algoritmu. Poslední část práce se zabývá popisem skriptu sloužícím ke generování reportů, které mohou být využity k diagnostickým účelům ve Fakultní nemocnici Brno.cs
dc.description.abstractThis bachelor´s thesis deals with the analysis of the human intestinal microbiome from 16S rRNA data. In the first part, the intestinal microbiome is theoretically described, and then the methods of its processing and evaluation using analysis of taxonomic categories and sample diversity are mentioned. The second part focuses on the data processed in the thesis and the format in which those data are provided. In the third part, the proposed algorithm used to process the data is described, and the results obtained by running this algorithm are evaluated. In the fourth part of the thesis, the samples from the University Hospital Brno are processed using the proposed algorithm. The last part of the thesis focuses on the script, which is used to generate the reports which can be used for diagnostic purposes in the University Hospital Brno.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationZBUDILOVÁ, M. Zpracování a analýza lidského střevního mikrobiomu ze sekvenačních dat 16S rDNA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.cs
dc.identifier.other150836cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/210846
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectstřevní mikrobiomcs
dc.subject16S rRNAcs
dc.subjectanalýzacs
dc.subjectdiverzitacs
dc.subjecttaxonomiecs
dc.subjectintestinal microbiomeen
dc.subject16S rRNAen
dc.subjectanalysisen
dc.subjectdiversityen
dc.subjecttaxonomyen
dc.titleZpracování a analýza lidského střevního mikrobiomu ze sekvenačních dat 16S rDNAcs
dc.title.alternativeProcessing and analysis of the human gut microbiome from 16S rDNA sequencing dataen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2023-06-14cs
dcterms.modified2023-06-16-08:34:01cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid150836en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.17 16:27:25en
sync.item.modts2025.01.15 16:07:55en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
11.85 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
35.53 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_150836.html
Size:
4.14 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_150836.html
Download
Collections
2023