Vyhledávání exonů pomocí Fourierovy transformace

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (člen) doc. MUDr. Iva Slaninová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Kolář položil otázku, čím si student vysvětluje nízkou hodnotu specificity? Doc. Drastich položil otázku, jak může proběhnout transformace z časového prostoru do frekvenčního? Student odpověděl na otázky členů komise. Student obhájil bakalářskou práci.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorRusina, Michalcs
dc.contributor.refereeVítková, Helenacs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractV této bakalářské práci jsou popsány metody predikce exonů. První část práce je zaměřena na rozdíl mezi prokaryotickými a eukaryotickými organismy, popis struktury DNA a vysvětlení pojmů exon a intron. Druhý úsek teoretické části obsahuje čtyři metody predikce exonů a to dynamické programování, neuronové sítě, skryté Markovovy modely a diskrétní Fourierovu transformaci. V praktické části byl vytvořen program Predikce_exonu, který vyhledává exony v nukleotidových sekvencích a pracuje na principu Fourierovy transformace. Tento algoritmus spolu s třemi volně dostupnými programy byl testován na 25 sekvencích a úspěšnost jejich predikce byla popsána senzitivitou a specificitou.cs
dc.description.abstractIn this bachelor thesis there are described the methods of the prediction of exon. The first part is aimed at the difference between the prokaryotic and eukaryotic organisms, the description of the DNA structure and the explanation of the terms exon and intron. The second section of the theoretic part includes four methods of the prediction of exons namely dynamic programming, neural networks, hidden Markov models and discrete Fourier transform. In the practical part there was created the program called Predikce_exonu that searches exons in nucleotide sequences and works on the principle of the Fourier transform. This algorithm together with 3 freely available programs was tested on 25 sequences and the success of their prediction was described by sensitivity and specificity.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationRUSINA, M. Vyhledávání exonů pomocí Fourierovy transformace [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other65421cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/26179
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectexoncs
dc.subjectintroncs
dc.subjecttranskripcecs
dc.subjectab initio predikcecs
dc.subjecthledání podobnostícs
dc.subjectFourierova transformacecs
dc.subjectDNAen
dc.subjectexonen
dc.subjectintronen
dc.subjecttranscriptionen
dc.subjectab initio predictionen
dc.subjectsimilarity searchesen
dc.subjectFourier transformationen
dc.titleVyhledávání exonů pomocí Fourierovy transformacecs
dc.title.alternativeFourier transformation for exon predictionen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-19cs
dcterms.modified2013-06-24-09:48:26cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid65421en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:24:59en
sync.item.modts2025.01.15 20:36:39en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.98 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
152.22 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_65421.html
Size:
3.87 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_65421.html
Download
Collections
2013