RUSINA, M. Vyhledávání exonů pomocí Fourierovy transformace [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.
Student vypracoval kvalitní bakalářskou práci a splnil všechny body zadání. Na tématu pracoval aktivně. Z formálního hlediska je práce přehledně strukturovaná, literatura je správně citována a i převzaté obrázky jsou dobře čitelné. Teoretická část práce je dobře zpracovaná. Student prakticky realizoval aplikaci pro predikci kódujících úseků v DNA pomocí DFT. Aplikace je funkční a mohla by sloužit i k výukovým účelům. Aplikace pracuje s nejčastěji používaným datovým formátem FASTA pro DNA sekvence a výstup výsledků je graficky přehledný a výsledky lze exportovat do excel formátu. Pomocí této aplikace student analyzoval sadu sekvencí a výsledky srovnal s výsledky dalších volně dostupných nástrojů. Byla také provedena analýza vlivu velikosti okna a volby detekčního prahu na výsledky.
Student Michal Rusina se ve své práci zaměřil na predikci exonů s využité Fourierovy transformace. Vytvořil podrobnou literární rešerši popisující specifika výskytu kódujících a nekódujících úseků DNA s ohledem na eukaryotické a prokaryotické organismy a sestavil přehled soudobých technik k jejich predikci. V praktické části realizoval konkrétní metodu predikce exonů pomocí diskrétní Fourierovy transformace v posuvném okně pro eukaryotické sekvence. Výsledky své metody přehledně srovnává s volně dostupnými nástroji. Po formální stránce bych vytkla jen nepříliš vhodné členění kapitol a zejména v praktické části práce by bylo vhodné oddělit programovou realizaci a popis navrženého algoritmu. Takhle si musí čtenář prostudovat funkci každého tlačítka, editačních polí a posuvníků, aby pochopil princip navrženého přístupu. Po odborné stránce student prokázal, že se velmi dobře orientuje v dané problematice. Celkově hodnotím práci 92 body a stupněm A.
eVSKP id 65421