Emergentní vlastnosti sítě G1/S

but.committeeprof. RNDr. Jan Chvalina, DrSc. (předseda) prof. RNDr. Josef Šlapal, CSc. (místopředseda) doc. RNDr. Bohumil Maroš, CSc. (člen) doc. RNDr. Libor Čermák, CSc. (člen) doc. RNDr. Jaroslav Michálek, CSc. (člen) Prof. Bruno Rubino (člen) Prof. Amabile Tatone (člen)cs
but.jazykangličtina (English)
but.programAplikované vědy v inženýrstvícs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorPalumbo,, Pasqualeen
dc.contributor.authorDražková, Janaen
dc.contributor.refereeTomášek, Petren
dc.date.created2010cs
dc.description.abstractTato práce se zabývá buněčným cyklem kvasinky Saccgaromyces cerevisiae. Oblastí našeho zájmu je přechod mezi G1 a S fází, kde je naším cílem identifikovat velikosti buňky v době počátku DNA replikace. Nejprve se věnujeme nedávno publikovanému matematickému modelu, který popisuje mechanismy vedoucí k S fázi. Práce poskytuje detailní popis tohoto modelu, stejně jako časový průběh některých důležitých proteinů či jejich sloučenin. Dále se zabýváme pravděpodobnostním modelem aktivace replikačních počátků DNA. Nově uvažujeme vliv šíření DNA replikace mezi sousedícími počátky a analyzujeme jeho důsledky. Poskytujeme také senzitivní analýzu kritické velikosti buňky vzhledem ke konstantám popisujícím dynamiku reakcí v modelu G1/S přechodu.en
dc.description.abstractIn this thesis we deal with the cell cycle of the yeast Saccharomyces cerevisiae. We are interested in its G1 to S transition, and our main goal is to determine the cell size at the onset of its DNA replication. At first, we study a recent mathematical model describing the mechanisms leading to the S phase, we provide its detailed description and present the dynamics of some significant protein and protein complexes. Further, we take a closer look at the probabilistic model for firing of DNA replication origins. We newly consider the influence of DNA replication spreading among neighboring origins, and we analyze its consequences. We also provide a sensitivity analysis of the critical cell size with respect to rate constants of G1 to S transition model.cs
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationDRAŽKOVÁ, J. Emergentní vlastnosti sítě G1/S [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2010.cs
dc.identifier.other26472cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/16487
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrstvícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectbuněčný cyklusen
dc.subjectSaccharomyces cerevisiaeen
dc.subjectDNA replikaceen
dc.subjectmatematický modelen
dc.subjectcell cyclecs
dc.subjectSaccharomyces cerevisiaecs
dc.subjectDNA replicationcs
dc.subjectmathematical modelcs
dc.titleEmergentní vlastnosti sítě G1/Sen
dc.title.alternativeEmergent properties of the G1/S networkcs
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2010-06-23cs
dcterms.modified2010-08-31-10:45:14cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta strojního inženýrstvícs
sync.item.dbid26472en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.27 06:48:08en
sync.item.modts2025.01.17 12:39:44en
thesis.disciplineMatematické inženýrstvícs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. Ústav matematikycs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
933.2 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
32.21 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_26472.html
Size:
5.27 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_26472.html
Collections