Vývoj postupu pro MLST typování Treponema pallidum subsp. pallidum

Simple item page
but.committeedoc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (předseda) Ing. Markéta Jakubíčková, Ph.D. (místopředseda) Ing. Martin Vítek, Ph.D. (člen) Ing. Martin Mézl, Ph.D. (člen) Ing. Jana Musilová, Ph.D. (člen) Ing. Radovan Smíšek, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka se vyjádřila k posudkům a odpověděla na otázku oponenta: jak bylo počítáno pokrytí a podobnost genů? Ing. Vítek: Myslíte, že je ta práce doplnitelná přes prázdniny? Komise se usnesla, že práce vykazuje závažné nedostatky v praktické části. Studentka neobhájila diplomovou práci.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce nebyla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorČejková, Darinacs
dc.contributor.authorTaliánová, Eliškacs
dc.contributor.refereeJakubíčková, Markétacs
dc.date.created2024cs
dc.description.abstractPráce se zabývá problematikou MLST typování Treponema pallidum subsp. pallidum. Tato spirochetní bakterie způsobuje nemoc syfilis. MLST typování představuje významný zdroj informací, jak o sekvenčních změnách genů, tak o jejich dopadech na patogenitu této bakterie. Snaží se navrhnout postup pro určení alelického profilu s využitím SRA dat. Využívá BWA mapování na referenční genom.cs
dc.description.abstractThis thesis is focused on MLST typing Treponema pallidum subsp. pallidum. This spirochete bacterium causes the disease syphilis. MLST typing represents an important source of information, both on the sequence changes of genes and on their impact on the pathogenicity of this bacterium. It tries to design a metod for obtaining the allelic profile using SRA data. It uses BWA mapping to the reference genome.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationTALIÁNOVÁ, E. Vývoj postupu pro MLST typování Treponema pallidum subsp. pallidum [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024.cs
dc.identifier.other159824cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/246233
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMLST typovánícs
dc.subjectTreponema pallidum subsp. pallidumcs
dc.subjectsyfiliscs
dc.subjectSRA databázecs
dc.subjectBWAcs
dc.subjectTP0136cs
dc.subjectTP0548cs
dc.subjectTP0705cs
dc.subjectkmen Nicholscs
dc.subjectkmen SS14cs
dc.subjectMLST typingen
dc.subjectTreponema pallidum subsp. pallidumen
dc.subjectsyphilisen
dc.subjectSRA databaseen
dc.subjectBWAen
dc.subjectTP0136en
dc.subjectTP0548en
dc.subjectTP0705en
dc.subjectNichols strainen
dc.subjectSS14 strainen
dc.titleVývoj postupu pro MLST typování Treponema pallidum subsp. pallidumcs
dc.title.alternativeDevelopment of the workflow for MLST typing of Treponema pallidum subsp. pallidumen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2024-06-10cs
dcterms.modified2025-06-16-15:07:21cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid159824en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.06.17 05:57:08en
sync.item.modts2025.06.17 05:33:08en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs

Files

Original bundle

Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.5 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
467.12 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_159824.html
Size:
6.01 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_159824.html
Download

Collections

2024