Automatic Detection of Eye Retinal Pathologies

but.committeeprof. Dr. Ing. Pavel Zemčík, dr. h. c. (předseda) doc. Ing. Lukáš Burget, Ph.D. (místopředseda) doc. Mgr. Lukáš Holík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. Jaroslav Dytrych, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Petr Matoušek, Ph.D., M.A. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A. Otázky u obhajoby: What parameters, learning procedures and loss functions did you experiment with before you selected the final configuration? What are the specifics of the task or data that led you to choose the U-Net architecture and the additional procedures you selected? What do you see as the benefit of training multiple models with different resolutions?cs
but.jazykangličtina (English)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorDrahanský, Martinen
dc.contributor.authorTlustoš, Víten
dc.contributor.refereeBeran, Vítězslaven
dc.date.created2022cs
dc.description.abstractCílem této práce je navrhnout a vyvinout systém, který automaticky odhalí vybrané patologie nacházející se na snímcích sítnice lidského oka.  Sítnice jako jediný orgán v těle obsahuje světlocitlivé buňky potřebné k vidění. Proto, aby byla léčba onemocnění sítnice úspěšná je klíčové jeho včasné zachycení a přesné určení rozsahu. Navržený systém automaticky k dodanému snímku vygeneruje segmentační masky reprezentující výskyt jednotlivých patologií. Výsledek je poté prezentován uživateli. O samotné vyhodnocení se stará konvoluční neuronová síť jejímž základem je architektura U-Net. Síť byla natrénovaná na datasetu Indian Diabetic Retinopathy Image Dataset zkráceně IDRiD, který obsahuje 81 snímků sítnice a k nim příslušících anotací. Úspěšnost navrhovaného systému byla stanovena pomocí AUC-PR skóre (plocha pod precision-recall křivkou). Segmentace tvrdých exsudátů, měkkých exsudátů, hemoragií a mikroaneuryzmat dosáhla hodnot AUC-PR 74%, 50%, 45% a 33%, v daném pořadí. Tato práce přináší inovativní architekturu, která má v případě dalšího rozvoje potenciál být využita oftalmology pro diagnostiku a stanovení rozsahu onemocnění sítnice oka.en
dc.description.abstractThis thesis aims to design and implement a system that automatically detects retinal eye pathologies. The retina is an essential part of the eye that, as the only organ in the body, contains light-sensitive cells that make a vision possible. For the treatment of eye disease to be successful, early detection and precise examination of its extent are crucial. The proposed system based on the supplied image automatically generates masks representing occurrences of individual pathologies. The result is then presented to the user. A convolutional neural network based on the U-Net architecture handles the evaluation. The network was trained on the Indian Diabetic Retinopathy Image Dataset (IDRiD), which contains 81 images of the retina and associated annotations. The system was evaluated using the AUC-PR score (area under the precision-recall curve). Segmentation of hard exudates, soft exudates, hemorrhages and microaneurysms achieved an AUC-PR score of 74%, 50%, 45% and 33%, respectively. This work proposes an innovative architecture that, if further developed, has the potential to be used by ophthalmologists for diagnosing and determining the extent of retinal disease.cs
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationTLUSTOŠ, V. Automatic Detection of Eye Retinal Pathologies [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2022.cs
dc.identifier.other145337cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/207448
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectbioinformatikaen
dc.subjectlidské okoen
dc.subjectsítnice okaen
dc.subjectzpracování obrazuen
dc.subjectsegmentaceen
dc.subjectpatologie sítnice okaen
dc.subjectstrojové učeníen
dc.subjectneuronové sítěen
dc.subjectbioinformaticscs
dc.subjecthuman eyecs
dc.subjecteye retinacs
dc.subjectimage processingcs
dc.subjectsegmentationcs
dc.subjecteye retinal pathologiescs
dc.subjectmachine learningcs
dc.subjectneural networkscs
dc.titleAutomatic Detection of Eye Retinal Pathologiesen
dc.title.alternativeAutomatic Detection of Eye Retinal Pathologiescs
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2022-06-14cs
dcterms.modified2022-06-20-10:23:14cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid145337en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.18 19:44:03en
sync.item.modts2025.01.15 21:54:09en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav inteligentních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 4 of 4
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
11.95 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-25232_v.pdf
Size:
85.76 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-25232_v.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-25232_o.pdf
Size:
91.18 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-25232_o.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_145337.html
Size:
1.45 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_145337.html
Collections