Klasifikace bakterií z numerických reprezentací genomu

but.committeedoc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Provazník položil otázky - Použité bakterie jste měl zadané nebo jste si je zvolil sám? Co můžete říct o velikostech genomu použitých bakterií? Mgr. Durnová položila otázku - Hodnotil jste bakterie i na základě nemocí které způsobují nebo na základě podobnosti jejich názvů? Student obhájil diplomovou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorOweis, Kamilcs
dc.contributor.refereeJugas, Robincs
dc.date.created2019cs
dc.description.abstractModerní metody zpracování genomických dat přinášejí kvalitní výsledky, avšak velmi často jsou vykoupeny časovou náročností. A právě proto se tato práce zabývá numerickými metodami zpracování bakteriálního genomu, které by mohly být vhodnou alternativou pro současné metody, a to jak po stránce kvality, tak po stránce výpočetní náročnosti. V práci jsou postupně představeny současné metody pro zpracování genomů in silico a navrženy vhodné numerické reprezentace pro celogenomovou analýzu. Některé z těchto metod jsou naprogramovány a jsou využity v diplomové práci, kde jsou testovány různé matematické a statistické metody, které by mohly vést k úspěšnému druhovému rozlišení bakterií podle numerických reprezentací jejich genomů.cs
dc.description.abstractModern methods of processing genomic data yield good results, however they are often redeemed by time consummation. This is mainly the reason why this thesis deals with numerical methods of bacterial genome processing which could be a suitable alternative for current methods, both in terms of quality and computational demands. This thesis presents the current methods used for processing of genomes in silico and proposes suitable numerical presentations for the whole genome analysis. Some of these methods are programmed and used for processing further in this diploma thesis. In it, various mathematical and statistical methods are being tested, ones that could lead to successful species delineation of bacteria by numerical presentations of their genomes.en
dc.description.markDcs
dc.identifier.citationOWEIS, K. Klasifikace bakterií z numerických reprezentací genomu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2019.cs
dc.identifier.other118345cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/177637
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectNumerické reprezentace bakteriálních genomůcs
dc.subjectbakteriecs
dc.subjectgenomcs
dc.subjectvymezení druhůcs
dc.subjectmetody delineace in silicocs
dc.subjectNumerical representations of bacterial genomeen
dc.subjectbacteriaen
dc.subjectgenomeen
dc.subjectspecies delineationen
dc.subjectdelineation methods in silicoen
dc.titleKlasifikace bakterií z numerických reprezentací genomucs
dc.title.alternativeBacterial species delineation based on parameters derived from numerical representations of genomeen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2019-06-05cs
dcterms.modified2019-08-29-09:18:33cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid118345en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:36:20en
sync.item.modts2025.01.15 14:32:47en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.56 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.rar
Size:
8.75 KB
Format:
Unknown data format
Description:
appendix-1.rar
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_118345.html
Size:
5.67 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_118345.html
Collections