Klasifikace bakterií z numerických reprezentací genomu
but.committee | doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen) | cs |
but.defence | Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Provazník položil otázky - Použité bakterie jste měl zadané nebo jste si je zvolil sám? Co můžete říct o velikostech genomu použitých bakterií? Mgr. Durnová položila otázku - Hodnotil jste bakterie i na základě nemocí které způsobují nebo na základě podobnosti jejich názvů? Student obhájil diplomovou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta. | cs |
but.jazyk | čeština (Czech) | |
but.program | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
dc.contributor.advisor | Maděránková, Denisa | cs |
dc.contributor.author | Oweis, Kamil | cs |
dc.contributor.referee | Jugas, Robin | cs |
dc.date.created | 2019 | cs |
dc.description.abstract | Moderní metody zpracování genomických dat přinášejí kvalitní výsledky, avšak velmi často jsou vykoupeny časovou náročností. A právě proto se tato práce zabývá numerickými metodami zpracování bakteriálního genomu, které by mohly být vhodnou alternativou pro současné metody, a to jak po stránce kvality, tak po stránce výpočetní náročnosti. V práci jsou postupně představeny současné metody pro zpracování genomů in silico a navrženy vhodné numerické reprezentace pro celogenomovou analýzu. Některé z těchto metod jsou naprogramovány a jsou využity v diplomové práci, kde jsou testovány různé matematické a statistické metody, které by mohly vést k úspěšnému druhovému rozlišení bakterií podle numerických reprezentací jejich genomů. | cs |
dc.description.abstract | Modern methods of processing genomic data yield good results, however they are often redeemed by time consummation. This is mainly the reason why this thesis deals with numerical methods of bacterial genome processing which could be a suitable alternative for current methods, both in terms of quality and computational demands. This thesis presents the current methods used for processing of genomes in silico and proposes suitable numerical presentations for the whole genome analysis. Some of these methods are programmed and used for processing further in this diploma thesis. In it, various mathematical and statistical methods are being tested, ones that could lead to successful species delineation of bacteria by numerical presentations of their genomes. | en |
dc.description.mark | D | cs |
dc.identifier.citation | OWEIS, K. Klasifikace bakterií z numerických reprezentací genomu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2019. | cs |
dc.identifier.other | 118345 | cs |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/177637 | |
dc.language.iso | cs | cs |
dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
dc.subject | Numerické reprezentace bakteriálních genomů | cs |
dc.subject | bakterie | cs |
dc.subject | genom | cs |
dc.subject | vymezení druhů | cs |
dc.subject | metody delineace in silico | cs |
dc.subject | Numerical representations of bacterial genome | en |
dc.subject | bacteria | en |
dc.subject | genome | en |
dc.subject | species delineation | en |
dc.subject | delineation methods in silico | en |
dc.title | Klasifikace bakterií z numerických reprezentací genomu | cs |
dc.title.alternative | Bacterial species delineation based on parameters derived from numerical representations of genome | en |
dc.type | Text | cs |
dc.type.driver | masterThesis | en |
dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
dcterms.dateAccepted | 2019-06-05 | cs |
dcterms.modified | 2019-08-29-09:18:33 | cs |
eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
sync.item.dbid | 118345 | en |
sync.item.dbtype | ZP | en |
sync.item.insts | 2025.03.26 13:36:20 | en |
sync.item.modts | 2025.01.15 14:32:47 | en |
thesis.discipline | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
thesis.level | Inženýrský | cs |
thesis.name | Ing. | cs |
Files
Original bundle
1 - 3 of 3
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 3.56 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- appendix-1.rar
- Size:
- 8.75 KB
- Format:
- Unknown data format
- Description:
- appendix-1.rar
Loading...
- Name:
- review_118345.html
- Size:
- 5.67 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_118345.html