Systém pro zpracovaní skóre z metod identifikace proteinů v tandemové hmotnostní spektrometrii

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Jiří Jan, CSc. (místopředseda) doc. RNDr. Ing. Jiří Šimurda, CSc. (člen) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (člen) Ing. Josef Halámek, CSc. (člen) doc. Ing. Jan Münz, CSc. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen)cs
but.defence1. Student prezentoval výsledky své diplomové práce na téma systém pro zarovnání skóre z metod identifikace proteinů v tandemové hmotnostní spektrometrii. 2. Čtení posudků vedoucího diplomové práce a oponenta. 3. Student odpověděl na všechny dotazy oponenta s porozuměním. 4. prof. Provazník. Jakým parametrem je dána robustnost algoritmu? Student odpověděl s porozuměním. 5. prof. Provazník. Jaká je výpočetní náročnost daných algoritmů? Student odpověděl s porozuměním. 6. Ing. Halámek. Jaký datový soubor jste měl k dispozici a jakým zbůsobem jste v práci postupoval? Student odpověděl s porozuměním. 7. Ing. Halámek Srovnával jste svoje výsledky s výsledkem zlatého standardu? Student odpověděl s porozuměním. 8. doc. Šimurda. Do jaké míry je Vámi navržená metoda spolehlivá? Student odpověděl s porozuměním.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programElektrotechnika, elektronika, komunikační a řídicí technikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorProvazník, Ivocs
dc.contributor.authorValla, Martincs
dc.contributor.refereeSvobodová-Vařeková, Radkacs
dc.date.accessioned2019-04-03T22:12:02Z
dc.date.available2019-04-03T22:12:02Z
dc.date.created2008cs
dc.description.abstractCílem práce bylo nalezení metody generující jeden určující parametr pro sjednocení výsledků z různých nástrojů identifikace proteinů v tandemové hmotnostní spektrometrii. Data na výstupu z hmotnostního spektrometru jsou zpracována ve dvou na sobě nezávislých nástrojích Mascot a X!Tandem. Výsledky jsou pak navrženou metodou zpracovány a unifikovány jediným parametrem jednoznačně určujícím identifikaci nalezených proteinů. Navržený skórovací parametr se označuje jako Metaskóre a je výstupem metody, která byla implementována v prostředí MATLAB a prakticky ověřena na reálných datech z veřejně přístupné databáze.cs
dc.description.abstractThe goal of my diploma thesis was finding a suitable method for unifying score values from various protein identification search tools in MS/MS mass spectrometry into one single score value. Data coming from the output of mass spectrometer are processed in two independent search tools Mascot and X!Tandem. These were selected especially for their wide usage in proteomic labs. Both results are evaluated through newly designed function and unified by single valued score clearly identifying found proteins. Newly designed scoring value is called Matascore and function producing this score was implemented in MATLAB. Function and its results were successfully tested by real data available in public databases on the Internet.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationVALLA, M. Systém pro zpracovaní skóre z metod identifikace proteinů v tandemové hmotnostní spektrometrii [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2008.cs
dc.identifier.other12207cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/12890
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectOhodnocenícs
dc.subjectMascotcs
dc.subjectX!Tandemcs
dc.subjectMetaskórecs
dc.subjectTMScs
dc.subjectpeptidová mapacs
dc.subjecttandemová hmotnostní spektrometrie.cs
dc.subjectScoreen
dc.subjectMascoten
dc.subjectX!Tandemen
dc.subjectMetascoreen
dc.subjectMS/MSen
dc.subjectpeptide mass fingerprinten
dc.subjecttandem mass spectrometry.en
dc.titleSystém pro zpracovaní skóre z metod identifikace proteinů v tandemové hmotnostní spektrometriics
dc.title.alternativeScoring Processing System for Protein Identification in Tandem Mass Spectrometryen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2008-06-10cs
dcterms.modified2008-06-11-12:21:37cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid12207en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2020.03.31 22:40:14en
sync.item.modts2020.03.31 20:29:09en
thesis.disciplineBiomedicínské a ekologické inženýrstvícs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.51 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.docx
Size:
2.1 MB
Format:
Unknown data format
Description:
appendix-1.docx
Download
Thumbnail Image
Name:
review_12207.html
Size:
11.83 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_12207.html
Download
Collections
2008