Shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primární struktury

Simple item page
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBurgetová, Ivanacs
dc.contributor.authorJurásek, Petrcs
dc.contributor.refereeStryka, Lukášcs
dc.date.createdcs
dc.description.abstractDiplomová práce je zaměřena na shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primárních struktur. Seznamuje s daty v podobě aminokyselin, které tvoří primární strukturu proteinů. Představuje základní algoritmy pro porovnávání podobnosti proteinových sekvencí. Popisuje shlukovou analýzu a metody shlukování. Praktickou část práce představuje návrh vzdálenostní funkce pro proteiny a implementace metod shlukování AGNES, k-means, k-medoids v jazyce Python.cs
dc.description.abstractThis master's thesis consider clustering of protein sequences based on primary structure of proteins. Studies the protein sequences from they primary structure. Describes methods for similarities in the amino acid sequences of proteins, cluster analysis and clustering algorithms. This thesis presents concept of distance function based on similarity of protein sequences and implements clustering algorithms ANGES, k-means, k-medoids in Python programming language.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationJURÁSEK, P. Shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primární struktury [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. .cs
dc.identifier.other25517cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/53904
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMolekulární biologiecs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectaminokyselinacs
dc.subjectproteincs
dc.subjectproteinové sekvencecs
dc.subjectdynamické programovánícs
dc.subjectNeedleman-Wunsch algoritmuscs
dc.subjectSmith-Waterman algoritmuscs
dc.subjectsubstituční maticecs
dc.subjectPAMcs
dc.subjectBLOSUMcs
dc.subjectshlukovánícs
dc.subjectshluková analýzacs
dc.subjectAGNEScs
dc.subjectk-meanscs
dc.subjectk-medoidscs
dc.subjectMolecular biologyen
dc.subjectDNAen
dc.subjectamino aciden
dc.subjectproteinen
dc.subjectprimary structure of proteinen
dc.subjectdynamic programingen
dc.subjectNeedleman-Wunsh algorithmen
dc.subjectSmith-Waterman algorithmen
dc.subjectscoring matrixen
dc.subjectPAMen
dc.subjectBLOSUMen
dc.subjectclusteringen
dc.subjectcluster analysisen
dc.subjectAGNESen
dc.subjectk-meansen
dc.subjectk-medoidsen
dc.titleShlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primární strukturycs
dc.title.alternativeClustering of Protein Sequences Based on Primary Structure of Proteinsen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.modified2020-05-09-23:40:12cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid25517en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 15:09:16en
sync.item.modts2025.01.15 16:53:53en
thesis.disciplineInteligentní systémycs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
606.5 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
review_25517.html
Size:
1.47 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_25517.html
Download
Collections
2008