Izolace bakteriální DNA z potravin s využitím magnetických nosičů
but.committee | prof. Ing. Peter Šimko, DrSc. (předseda) doc. Ing. Jiřina Omelková, CSc. (místopředseda) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (člen) doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (člen) doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (člen) | cs |
but.defence | 1. Diplomantka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce. 2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci. 3. Diplomantka akceptovala všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděla v plné šíři. 4. Diskuse: doc. Márová Co bylo měrnou sondou, byla to sonda jednovláknová nebo dvouvláknová? Studentka otázku komise úspěšně zodpověděla. | cs |
but.jazyk | čeština (Czech) | |
but.program | Chemie a technologie potravin | cs |
but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
dc.contributor.advisor | Španová, Alena | cs |
dc.contributor.author | Bubeníková, Lucia | cs |
dc.contributor.referee | Horák, Daniel | cs |
dc.date.created | 2011 | cs |
dc.description.abstract | Práce byla zaměřena na selektivní izolaci bakteriální DNA pomocí magnetických nosičů se streptavidinem (PGMA-NH2-STV, MPG® Streptavidin). Byly optimalizovány podmínky funkcionalizace nosičů dvěma biotinylovanými sondami: množství nosiče, množství sondy, vazba biotinylové sondy na streptavidin. Pro hybridizaci byla použita purifikovaná DNA Lactobacillus. Byla testována vazba DNA na sondu (DNA/DNA hybridizace) a nespecifická vazba DNA na částice. Cílová DNA, eluovaná z nosiče, byla identifikována pomocí PCR s primery R16-1 a LbLMA1-rev a s primery P_eub a F_eub. Množství sondy navázané na nosič bylo stanoveno spektrofotometricky. Bylo zjištěno, že k funkcionalizaci lze použít biotinylovanou sondu o koncentraci 5 pmol/µl, přidávanou k nosiči v poměru nosič:sonda 1:1. Bylo ukázáno, že nespecifická adsorpce DNA na nosič MPG® Streptavidin je výrazně menší než na nosič PGMA-NH2-STV. DNA/DNA hybridizací s využitím nosiče MPG® Streptavidin byla izolována DNA z čisté kultury Lactobacillus. Postup byl aplikován na izolaci DNA z mléčných výrobků. | cs |
dc.description.abstract | The aim of the work was the selective isolation of bacterial DNA with help of magnetic carriers covered by streptavidine (PGMA-NH2-STV, MPG® Streptavidin). Conditions of functionalisation of carriers using two biotinylated probes were optimized: the amount of carrier, the amount of probe, binding of biotinyled probe to streptavidine. Purified DNA Lactobacillus was used for hybridization. DNA binding to the probe (DNA/DNA hybridization) and nospecific adsorption of DNA to the carrier were tested. Target DNA eluted from the carrier was identified using PCR with primers R16-1 and LbLMA1-rev and with primers P_eub and F_eub. The amount of probe bound to the carrier was estimated using UV spectrophotometry. It was estimated that biotinyled probe can be used for functionalisation in concentration 5 pmol/µl added to the carrier in the ration carrier : probe 1:1. It was shown that nonspecific DNA adsorption to the MPG® Streptavidin is significantly lower than to the carrier PGMA-NH2-STV.Using DNA/DNA hybridization and the MPG® Streptavidin, DNA from pure culture Lactobacillus was isolated. Procedure was applicated for DNA isolation from milk products. | en |
dc.description.mark | A | cs |
dc.identifier.citation | BUBENÍKOVÁ, L. Izolace bakteriální DNA z potravin s využitím magnetických nosičů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2011. | cs |
dc.identifier.other | 33151 | cs |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/3125 | |
dc.language.iso | cs | cs |
dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická | cs |
dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
dc.subject | magnetické nosiče | cs |
dc.subject | streptavidin-biotin | cs |
dc.subject | selektivní izolace DNA | cs |
dc.subject | PCR | cs |
dc.subject | potraviny | cs |
dc.subject | magnetic carriers | en |
dc.subject | streptavidin-biotin | en |
dc.subject | selective isolation of DNA | en |
dc.subject | PCR | en |
dc.subject | foods | en |
dc.title | Izolace bakteriální DNA z potravin s využitím magnetických nosičů | cs |
dc.title.alternative | Isolation of bacterial DNA from foods using magnetic carriers | en |
dc.type | Text | cs |
dc.type.driver | masterThesis | en |
dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
dcterms.dateAccepted | 2011-06-07 | cs |
dcterms.modified | 2024-05-17-12:54:15 | cs |
eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta chemická | cs |
sync.item.dbid | 33151 | en |
sync.item.dbtype | ZP | en |
sync.item.insts | 2025.03.26 09:43:53 | en |
sync.item.modts | 2025.01.15 13:42:01 | en |
thesis.discipline | Potravinářská chemie a biotechnologie | cs |
thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav chemie potravin a biotechnologií | cs |
thesis.level | Inženýrský | cs |
thesis.name | Ing. | cs |