Rekonstrukce transposonů

but.committeeprof. RNDr. Alexandr Meduna, CSc. (předseda) doc. Ing. Lukáš Burget, Ph.D. (místopředseda) doc. Mgr. Lukáš Holík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jiří Jaroš, Ph.D. (člen) Ing. Zbyněk Křivka, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázku oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm E. Otázky u obhajoby: Ve své práci ověřujete primárně dva modely LTR transpozonů (Copia, Gypsy). Lze do vašeho nástroje zakomponovat i další modely? Pokud ano, co všechno je potřeba nastavit/změnit?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorPuterová, Jankacs
dc.contributor.authorŠurina, Olivercs
dc.contributor.refereeMartínek, Tomášcs
dc.date.created2016cs
dc.description.abstractTáto práca sa zaoberá rekonštrukciou transpozónov na základe výstupu programu RepeatExplorer. V prvej časti práca predstavuje základy molekulárnej biológie so zameraním na transpozóny a ich štruktúru. Ďalej popisuje návrh a implementáciu aplikácie, ktorá rekonštruuje transpozóny na základe výstupov RepeatExploreru. K prezentácii dosiahnutých výsledkov bolo vytvorené interaktívne grafické uživateľské rozhranie. Aplikácia bola ná- sledne testovaná v realnom prostredí. Práca tiež prináša prehľad o existujúcich nástrojoch pre identifikáciu transpozónov.cs
dc.description.abstractThis thesis deals with the reconstruction of transposable elements based on an output of RepeaterExplorer. In the first section, this thesis introduces basics of molecular biology with focus on transposons and their structure. Then it describes design and implementation of application which reconstructs transposons based on an output of RepeatExplorer. Achieved results are presented by created interactive user interface. The application was then tesed in real enviroment. This thesis also delivers overview of existing tools for transposons identification.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationŠURINA, O. Rekonstrukce transposonů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2016.cs
dc.identifier.other96616cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/62030
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAcs
dc.subjecttranspozónycs
dc.subjectLTRcs
dc.subjectRepeatExplorercs
dc.subjectrekonstrukce transpozónovcs
dc.subjectGUIcs
dc.subjectDNAen
dc.subjecttransposonsen
dc.subjectLTRen
dc.subjectRepeatExploreren
dc.subjecttransposons reconstructionen
dc.subjectGUIen
dc.titleRekonstrukce transposonůcs
dc.title.alternativeReconstruction of Transposonsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2016-06-15cs
dcterms.modified2020-05-10-16:12:46cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid96616en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.18 18:54:54en
sync.item.modts2025.01.17 14:16:36en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 4 of 4
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.62 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-18960_v.pdf
Size:
88.44 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file Posudek-Vedouci prace-18960_v.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-18960_o.pdf
Size:
93.56 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file Posudek-Oponent prace-18960_o.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_96616.html
Size:
1.42 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_96616.html
Collections