Hodnocení migrace značených buněk v tkáni
| but.committee | prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. RNDr. Martin Kovár, Ph.D. (místopředseda) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Odstrčilík položil otázku: použil jste nějakou segmentační metodu? Kterou? Jak jste vytvořil binární obraz? Prof. Provazník položil otázku: placaté buňky jsou myšleny jako buňky ploché? Jak jsou myšleny buňky kulaté? Doc. Kovár položil otázku: buňky sledujete na sklíčku nebo přimo v těle? Šlo by měřit přímo v těle, kdyby se použila jiná vlnová délka? Jak se buňky na sklíčku pohybují? Používá se označení buněk magneticky? Jak velká je nanočástice? Je schopna magnetická rezonance zachytit takovéto částice? Jaká je na magnetické rezonanci rozlišovací schopnost? Student obhájil diplomovou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta. | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Čmiel, Vratislav | cs |
| dc.contributor.author | Solař, Jan | cs |
| dc.contributor.referee | Skopalík, Josef | cs |
| dc.date.created | 2016 | cs |
| dc.description.abstract | Tato diplomová práce se zabývá rozborem moderních detekčních metod vizualizace, sledování a kvantifikace buněk v 3D prostoru. První část práce se zabývá optickými metodami detekce buněk. Je zde detailní rozbor problematiky fluorescenčního značení buněk a jejich detekce na konfokálním mikroskopu. Je zde popis vyvinutého algoritmu pro kvantifikaci celého buněčného objemu z mikroskopického obrazu. Díky tomu se porovnal signál fluorescence buněk v čase a podle jejich tvaru. Dále došlo k optimalizaci vizualizace vyvinutých tkáňových fantomů. Porovnaly se možnosti detekce buněk v těchto fantomech pomocí konfokální mikroskopie a OCT. Byl rovněž implementován algoritmus pro kvantifikaci buněk z OCT obrazů. Kromě konfokálního mikroskopu a OCT se buňky rovněž analyzovaly dalšími metodami. V poslední části je konkluze výsledků a srovnání jednotlivých použitých metod. | cs |
| dc.description.abstract | This diploma thesis deals with analysing of modern methods for cell detection, visualization and quantification in 3D space. The first section deals with optical methods for cells detection. There is detailed discussion about cell labeling and detection on confocal microscopy. There is also description about developed algorithm for whole cell volume quantification from microscopy images. This could made a comparsion of fluorescence signal according to time of cell labeling and according to cell shapes. There was also optimalization of handmade tissue phantoms visualization. It could be compared a possibilities of cell detections in these phantoms by confocal microscopy and OCT. It was also implemented algorithm for quantification of cells from OCT images. Besides confocal microscopy and OCT cells are also analyzed by other methods. The last part is the Conclusion of results and comparison of used methods. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | SOLAŘ, J. Hodnocení migrace značených buněk v tkáni [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2016. | cs |
| dc.identifier.other | 93560 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/59737 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Konfokální mikroskop | cs |
| dc.subject | OCT | cs |
| dc.subject | kvantifikace | cs |
| dc.subject | fluorescence | cs |
| dc.subject | migrace buněk | cs |
| dc.subject | detekce buněk | cs |
| dc.subject | Confocal microscopy | en |
| dc.subject | OCT | en |
| dc.subject | quantification | en |
| dc.subject | fluorescence | en |
| dc.subject | cell migration | en |
| dc.subject | cell detection | en |
| dc.title | Hodnocení migrace značených buněk v tkáni | cs |
| dc.title.alternative | Classification of marked cells migration in tissue | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2016-06-07 | cs |
| dcterms.modified | 2016-12-05-12:41:00 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 93560 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 13:22:51 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.17 11:51:57 | en |
| thesis.discipline | Biomedicínské inženýrství a bioinformatika | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |
Files
Original bundle
1 - 3 of 3
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 83.1 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- review_93560.html
- Size:
- 7.64 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_93560.html