Detailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií

but.committeeprof. Ing. Marek Penhaker, Ph.D. (předseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda) Doc. MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D. (člen) Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Vičar, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Gumulec se doptal, jak vypadají dostupná data. Jaká byla selekční kritéria pro výběr datasetů? Ing. Sedlář se doptal na kvalitu dat. Byly sekvence sekvenovány pomocí Ilumina? O jaké bakterie se jedná? Doc. Gumulec se zeptal jak funguje horizontální přenost pro Vaše data? Co jste dělala s daty, jak jste je zpracovala? Jak jste dospěla k popsaným informacím? Ing. Sedlář se zeptal, pracovala jste s nukleotidy nebo s predikovanými proteiny? Jak jste filtrovala coverage? Zvažovala jste coverage? Prof. Penhaker se doptal, co jste navrhla a implementovala v programovacím jazyce? Ing. Čmiel se doptal, jak byla vedoucí spokojena s výběrem databází? Studentka neobhájila bakalářskou práci. Komise shledala soulad posudku vedoucí a oponentky s neúplným vypracováním práce s ohledem na zadání.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce nebyla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorČejková, Darinacs
dc.contributor.authorVancová, Kateřinacs
dc.contributor.refereeSchwarzerová, Janacs
dc.date.accessioned2023-09-01T06:53:12Z
dc.date.available2023-09-01T06:53:12Z
dc.date.created2023cs
dc.description.abstractTato práce se zabývá detailní analýzou genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií. Antimikrobiální rezistence (AMR) u bakterií je celosvětově rostoucí hrozbou pro veřejné zdraví. U těchto bakterií jsou geny AMR často spojeny s mobilními genetickými elementy (MGE), které pod- porují jejich mobilitu a umožňují jim rychlé šíření mezi různými bakteriemi. V práci je popsán horizontální přenos genetické informace, problematika antimikrobiální rezistence a databáze pro detekci genů AMR a MGE. Poté byla provedena detekce a analýza genů AMR a MGE u zástupců anaerobních bakterií. Téměr polovina z nich obsahovala alespoň 1 gen AMR, celkem 112 různých genů. Poté bylo detekováno 66 různých MGE, 4 z nich přenášely 6 různých detekovaných genů AMR.cs
dc.description.abstractThis thesis deals with a detail analysis on antibiotic and heavy-metal resistance genes and horizontal gene transfer traits in anaerobic bacteria. Antimicrobial resistance (AMR) in bacteria is a growing threat to public health globally. In these bacteria, AMR genes are often associated with mobile genetic elements (MGEs), which promote their mobility, enabling them to rapidly spread throughout a bacterial community. The work describes the horizontal gene transfer, the issue of antimicrobial resistance and the database for the detection of AMR genes and MGEs. After that, the detection and analysis of AMR genes and MGEs in anaerobic bacteria was done. Almost half of them contained at least 1 gene coding for antibiotic or heavy-metal resistance, 112 different genes overall. Then, 66 different MGEs were detected, 4 of which carried 6 different AMR detected genes.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationVANCOVÁ, K. Detailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.cs
dc.identifier.other150834cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/213845
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectHorizontální přenos genůcs
dc.subjectmobilní genetické elementycs
dc.subjectbakteriecs
dc.subjectantimikrobiální re- zistencecs
dc.subjectgeny rezistencecs
dc.subjectdatabáze pro detekci genů rezistencecs
dc.subjectantibiotikacs
dc.subjecttěžké kovycs
dc.subjectHorizontal gene transferen
dc.subjectmobile genetic elementsen
dc.subjectbacteriaen
dc.subjectantimicrobial resistanceen
dc.subjectresistance genesen
dc.subjectdatabase for resistance gene detectionen
dc.subjectantibioticsen
dc.subjectheavy-metalsen
dc.titleDetailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakteriícs
dc.title.alternativeDetail analysis on antibiotic and heavy-metal resistance genes and horizontal gene transfer traits in anaerobic bacteriaen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2023-06-14cs
dcterms.modified2023-08-31-08:42:42cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid150834en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2023.09.01 08:53:12en
sync.item.modts2023.09.01 08:14:30en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
7.76 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
106.09 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_150834.html
Size:
5.93 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_150834.html
Collections