Predikce sekundární struktury RNA sekvencí

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Jiří Jan, CSc. (předseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda) doc. RNDr. Martin Kovár, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (člen) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen)cs
but.defencedoc. Hofr položil otázku: Jak byly vytvořeny obrázky prezentované v práci. Jak by se dal algoritmus upravit k získání korektních výsledků. doc. Kovár položil otázku: Jaké složky má volné energie? Studentka obhájila diplomovou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorKlímová, Markétacs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2015cs
dc.description.abstractSekundární struktura RNA hraje roli v mnoha biologických procesech. Efektivní predikce této struktury může poskytnout informace pro další zkoumání těchto procesů. V současnosti existuje mnoho dostupných programů pro predikci sekundární struktury RNA, některé pracují s jednou sekvencí RNA, jiné využívají více zarovnaných sekvencí organismů se společným předkem. U většiny metod jsou stále problémem pseudouzly. Tato práce představuje některé metody, veřejně dostupný software a popisuje vlastní realizaci metody minimalizace volné energie.cs
dc.description.abstractRNA secondary structure is very important in many biological processes. Efficient structure prediction can give information for experimental investigations of these processes. Many available programs for secondary structure prediction exist. Some of them use single sequence, the others use more related sequences. Pseudoknots are still problematic for most methods. This work presents several methods and publicly available software and the implementation of minimum free energy method is described.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationKLÍMOVÁ, M. Predikce sekundární struktury RNA sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.cs
dc.identifier.other84425cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/38951
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectRNAcs
dc.subjectpredikce sekundární strukturycs
dc.subjectmfoldcs
dc.subjectRNAfoldcs
dc.subjectSfoldcs
dc.subjectNussinov-Jacobsoncs
dc.subjectZukercs
dc.subjectminimalizace volné energiecs
dc.subjectRNAen
dc.subjectsecondary structure predictionen
dc.subjectmfolden
dc.subjectRNAfolden
dc.subjectSfolden
dc.subjectNussinov-Jacobsonen
dc.subjectZukeren
dc.subjectfree energy minimizationen
dc.titlePredikce sekundární struktury RNA sekvencícs
dc.title.alternativePrediction of RNA secondary structureen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2015-06-10cs
dcterms.modified2015-06-15-07:23:06cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid84425en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:18:26en
sync.item.modts2025.01.17 11:48:19en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.01 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
182.45 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_84425.html
Size:
5.68 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_84425.html
Download
Collections
2015