Nástroj pro vizualizaci transkriptomických dat

Abstract

Tato bakalářská práce se zabývá analýzou transkriptomu se zaměřením na vizualizaci transkriptomických dat. Teoretická část popisuje principy genové exprese, technologii RNA sekvenování a klíčové kroky bioinformatického zpracování, které připravují data pro analýzu diferenciální genové exprese. Dále popisuje principy této analýzy a možnosti vizualizace jejích výsledků. V praktické části byl navržen a realizován nástroj, který kombinuje analýzu diferenciální genové exprese s vizualizací dat pomocí různých grafických přístupů. Funkčnost nástroje byla ověřena na testovacím datasetu vytvořeném v rámci práce.This bachelor's thesis focuses on transcriptome analysis with an emphasis on the visualization of transcriptomic data. The theoretical part describes the principles of gene expression, RNA sequencing technology, and the key steps of bioinformatic data processing that prepare the data for differential gene expression analysis. It also covers the principles of this analysis and the methods for visualizing its results. In the practical part, a tool was designed and implemented that combines differential gene expression analysis with data visualization using various graphical approaches. The functionality of the tool was verified using a test dataset created as part of the thesis.