Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety

but.committeedoc. Ing. Jiří Hozman, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda) prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen) Ing. Kateřina Šabatová (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Janoušek položil otázku: Jak moc musela být data vyfiltrována a na základě čeho jste volil parametry filtrace? Ing. Jurečková položila otázku: Věděl jste jaká je diverzita daného vzorku? Prováděl jste srovnání s určitou studií? Na základě čeho byla provedena analýza hlavních komponent? Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykslovenština (Slovak)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBartoň, Vojtěchsk
dc.contributor.authorSpanakis, Martin Nikolaossk
dc.contributor.refereeČejková, Darinask
dc.date.created2023cs
dc.description.abstractTáto bakalárska práca sa zaoberá sekvenáciou mikrobiómu a jeho zložením. Zameriava sa na črevný mikrobióm zvierat, ktorý sa líši u zvierat s odlišnou stravou. Práca popisuje teoretické poznatky o metagenomickej analýze mikrobiómu, ako postupy pri odbere vzo- riek, rôzne metódy sekvenácie a spracovanie získaných dát. V praktickej časti práce je obsiahnutá príprava datasetu, ktorá zahŕňa zhromaždenie dát a ich prípravu na nasledu- júcu metagenomickú analýzu. Výsledkom práce je taxonomické zaradenie bakteriálnych druhov vo vzorkách a analýza ich diverzity podľa typu stravy jednotlivých živočíchov.sk
dc.description.abstractThis bachelor’s thesis deals with the sequencing of the microbiome and its composi- tion. It focuses on the gut microbiome of animals, which differs among animals with different diets. The work describes theoretical knowledge about metagenomic analysis of the microbiome, such as sampling procedures, various sequencing methods and data processing. The practical part of the work includes the preparation of the dataset, which includes the collection of data and their preparation for the following metagenomic anal- ysis. The result of the work is the taxonomic classification of bacterial species in the samples and the analysis of their diversity according to the type of diet of individual animals.en
dc.description.markDcs
dc.identifier.citationSPANAKIS, M. Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.cs
dc.identifier.other150825cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/212574
dc.language.isoskcs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectmikrobiómsk
dc.subjectmetagenómsk
dc.subjectsekvenáciask
dc.subjectDNAsk
dc.subjectvzorkask
dc.subject16S rRNAsk
dc.subjectFastQCsk
dc.subjectFastpsk
dc.subjectQIIME2sk
dc.subjecttaxonómiask
dc.subjectdiverzitask
dc.subjectmicrobiomeen
dc.subjectmetagenomeen
dc.subjectsequencingen
dc.subjectDNAen
dc.subjectsampleen
dc.subject16S rRNAen
dc.subjectFastQCen
dc.subjectFastpen
dc.subjectQIIME2en
dc.subjecttaxonomyen
dc.subjectdiversityen
dc.titleMetagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu dietysk
dc.title.alternativeMetagenomic analysis of animal gut microbioma based on dieten
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2023-06-14cs
dcterms.modified2023-08-02-07:44:07cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid150825en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.18 17:39:41en
sync.item.modts2025.01.15 22:39:29en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
5.18 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
2.33 MB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_150825.html
Size:
7.74 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_150825.html
Collections