Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety
but.committee | doc. Ing. Jiří Hozman, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda) prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen) Ing. Kateřina Šabatová (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen) | cs |
but.defence | Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Janoušek položil otázku: Jak moc musela být data vyfiltrována a na základě čeho jste volil parametry filtrace? Ing. Jurečková položila otázku: Věděl jste jaká je diverzita daného vzorku? Prováděl jste srovnání s určitou studií? Na základě čeho byla provedena analýza hlavních komponent? Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta. | cs |
but.jazyk | slovenština (Slovak) | |
but.program | Biomedicínská technika a bioinformatika | cs |
but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
dc.contributor.advisor | Bartoň, Vojtěch | sk |
dc.contributor.author | Spanakis, Martin Nikolaos | sk |
dc.contributor.referee | Čejková, Darina | sk |
dc.date.created | 2023 | cs |
dc.description.abstract | Táto bakalárska práca sa zaoberá sekvenáciou mikrobiómu a jeho zložením. Zameriava sa na črevný mikrobióm zvierat, ktorý sa líši u zvierat s odlišnou stravou. Práca popisuje teoretické poznatky o metagenomickej analýze mikrobiómu, ako postupy pri odbere vzo- riek, rôzne metódy sekvenácie a spracovanie získaných dát. V praktickej časti práce je obsiahnutá príprava datasetu, ktorá zahŕňa zhromaždenie dát a ich prípravu na nasledu- júcu metagenomickú analýzu. Výsledkom práce je taxonomické zaradenie bakteriálnych druhov vo vzorkách a analýza ich diverzity podľa typu stravy jednotlivých živočíchov. | sk |
dc.description.abstract | This bachelor’s thesis deals with the sequencing of the microbiome and its composi- tion. It focuses on the gut microbiome of animals, which differs among animals with different diets. The work describes theoretical knowledge about metagenomic analysis of the microbiome, such as sampling procedures, various sequencing methods and data processing. The practical part of the work includes the preparation of the dataset, which includes the collection of data and their preparation for the following metagenomic anal- ysis. The result of the work is the taxonomic classification of bacterial species in the samples and the analysis of their diversity according to the type of diet of individual animals. | en |
dc.description.mark | D | cs |
dc.identifier.citation | SPANAKIS, M. Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023. | cs |
dc.identifier.other | 150825 | cs |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/212574 | |
dc.language.iso | sk | cs |
dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
dc.subject | mikrobióm | sk |
dc.subject | metagenóm | sk |
dc.subject | sekvenácia | sk |
dc.subject | DNA | sk |
dc.subject | vzorka | sk |
dc.subject | 16S rRNA | sk |
dc.subject | FastQC | sk |
dc.subject | Fastp | sk |
dc.subject | QIIME2 | sk |
dc.subject | taxonómia | sk |
dc.subject | diverzita | sk |
dc.subject | microbiome | en |
dc.subject | metagenome | en |
dc.subject | sequencing | en |
dc.subject | DNA | en |
dc.subject | sample | en |
dc.subject | 16S rRNA | en |
dc.subject | FastQC | en |
dc.subject | Fastp | en |
dc.subject | QIIME2 | en |
dc.subject | taxonomy | en |
dc.subject | diversity | en |
dc.title | Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety | sk |
dc.title.alternative | Metagenomic analysis of animal gut microbioma based on diet | en |
dc.type | Text | cs |
dc.type.driver | bachelorThesis | en |
dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
dcterms.dateAccepted | 2023-06-14 | cs |
dcterms.modified | 2023-08-02-07:44:07 | cs |
eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
sync.item.dbid | 150825 | en |
sync.item.dbtype | ZP | en |
sync.item.insts | 2025.03.18 17:39:41 | en |
sync.item.modts | 2025.01.15 22:39:29 | en |
thesis.discipline | bez specializace | cs |
thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
thesis.level | Bakalářský | cs |
thesis.name | Bc. | cs |
Files
Original bundle
1 - 3 of 3
Loading...
- Name:
- final-thesis.pdf
- Size:
- 5.18 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- file final-thesis.pdf
Loading...
- Name:
- appendix-1.zip
- Size:
- 2.33 MB
- Format:
- Unknown data format
- Description:
- file appendix-1.zip
Loading...
- Name:
- review_150825.html
- Size:
- 7.74 KB
- Format:
- Hypertext Markup Language
- Description:
- file review_150825.html