Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety
Loading...
Date
Authors
Spanakis, Martin Nikolaos
ORCID
Advisor
Referee
Mark
D
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Táto bakalárska práca sa zaoberá sekvenáciou mikrobiómu a jeho zložením. Zameriava sa na črevný mikrobióm zvierat, ktorý sa líši u zvierat s odlišnou stravou. Práca popisuje teoretické poznatky o metagenomickej analýze mikrobiómu, ako postupy pri odbere vzo- riek, rôzne metódy sekvenácie a spracovanie získaných dát. V praktickej časti práce je obsiahnutá príprava datasetu, ktorá zahŕňa zhromaždenie dát a ich prípravu na nasledu- júcu metagenomickú analýzu. Výsledkom práce je taxonomické zaradenie bakteriálnych druhov vo vzorkách a analýza ich diverzity podľa typu stravy jednotlivých živočíchov.
This bachelor’s thesis deals with the sequencing of the microbiome and its composi- tion. It focuses on the gut microbiome of animals, which differs among animals with different diets. The work describes theoretical knowledge about metagenomic analysis of the microbiome, such as sampling procedures, various sequencing methods and data processing. The practical part of the work includes the preparation of the dataset, which includes the collection of data and their preparation for the following metagenomic anal- ysis. The result of the work is the taxonomic classification of bacterial species in the samples and the analysis of their diversity according to the type of diet of individual animals.
This bachelor’s thesis deals with the sequencing of the microbiome and its composi- tion. It focuses on the gut microbiome of animals, which differs among animals with different diets. The work describes theoretical knowledge about metagenomic analysis of the microbiome, such as sampling procedures, various sequencing methods and data processing. The practical part of the work includes the preparation of the dataset, which includes the collection of data and their preparation for the following metagenomic anal- ysis. The result of the work is the taxonomic classification of bacterial species in the samples and the analysis of their diversity according to the type of diet of individual animals.
Description
Citation
SPANAKIS, M. Metagenomická analýza střevního mikrobiomu u zvířat dle typu diety [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
sk
Study field
bez specializace
Comittee
doc. Ing. Jiří Hozman, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda)
prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen)
Ing. Kateřina Šabatová (člen)
Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen)
Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2023-06-14
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Janoušek položil otázku: Jak moc musela být data vyfiltrována a na základě čeho jste volil parametry filtrace? Ing. Jurečková položila otázku: Věděl jste jaká je diverzita daného vzorku? Prováděl jste srovnání s určitou studií? Na základě čeho byla provedena analýza hlavních komponent?
Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení