Techniky pro zarovnávání skupin biologických sekvencí
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Burgetová, Ivana | cs |
| dc.contributor.author | Hrazdil, Jiří | cs |
| dc.contributor.referee | Martínek, Tomáš | cs |
| dc.date.created | cs | |
| dc.description.abstract | Práce shrnuje způsoby reprezentace a formáty pro ukládání biologických sekvencí a popisuje databáze, ze kterých lze sekvence získat. V další části pojednává o metodách používaných pro zarovnání dvojice sekvencí. Následuje rozšíření použitých technik na problematiku zarovnání skupiny sekvencí a představení suboptimálních metod realizovatelných v rozumném čase. V praktické části práce je implementována aplikace pro zarovnání skupin sekvencí pomocí popsaných metod v jazyce Java. | cs |
| dc.description.abstract | This thesis summarizes ways of representation of biological sequences and file formats used for sequence exchange and storage. Next part deals with techniques used for sequence pairwise alignment, followed by extension of these techniques to the problem of multiple sequence alignment. Additional methods are introduced, that are suboptimal, but on the other hand are able to compute results in reasonable time. Practical part of this thesis consists of implementing multiple sequence alignment application in Java programming language. | en |
| dc.description.mark | C | cs |
| dc.identifier.citation | HRAZDIL, J. Techniky pro zarovnávání skupin biologických sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. . | cs |
| dc.identifier.other | 25736 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/53929 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | sekvence nukleotidů | cs |
| dc.subject | sekvence aminokyselin | cs |
| dc.subject | zarovnání sekvencí | cs |
| dc.subject | fylogenetický strom | cs |
| dc.subject | zarovnání skupiny sekvencí | cs |
| dc.subject | UPGMA | cs |
| dc.subject | Neighhbor-Joining | cs |
| dc.subject | nucleotide sequence | en |
| dc.subject | aminoacid sequence | en |
| dc.subject | sequence alignment | en |
| dc.subject | phylogenetic tree | en |
| dc.subject | multiple sequence alignment | en |
| dc.subject | UPGMA | en |
| dc.subject | Neighbor-Joining | en |
| dc.title | Techniky pro zarovnávání skupin biologických sekvencí | cs |
| dc.title.alternative | Techniques for Multiple Sequence Alignments | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-09-23:41:18 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 25736 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 15:09:38 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.17 11:47:33 | en |
| thesis.discipline | Informační systémy | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |