Bioinformatická analýza jednonukleotidových polymorfismů v databázi 1000 Genomes Project

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Martin Černý, Ph.D. (místopředseda) Ing. Radovan Jiřík, Ph.D. (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Mgr. Erik Staffa, Ph.D. (člen) MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Jiřík položil otázku: Byla celá analýza provedena v R? Jaký je rozdíl v databázích a proč? MUDr. Gumulec položil otázku: Jak lze Vaše výsledky dále využít? Co by znamenalo rozdělení clusteru (u PCA) na dvě skupiny? Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykangličtina (English)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorProvazník, Ivoen
dc.contributor.authorParobková, Viktóriaen
dc.contributor.refereeRoy, Sudeepen
dc.date.accessioned2020-06-24T07:57:08Z
dc.date.available2020-06-24T07:57:08Z
dc.date.created2020cs
dc.description.abstractSekvenovanie celého ľudského genómu a nájdenie jeho variácii bolo výzvou počas mnohých rokov. Znalosť všetkých genetických variácií je pozoruhodne prospešná pri výskume chorôb. Táto práca je zameraná na genetické variácie človeka a ich dva hlavné výskumné projekty, The HapMap Project a The 1000 Genomes Project, ktoré pomohli v analýze chorôb. Prvá časť práce je venovaná teoretickému popisu projektov. V nasledujúcej časti práce sú popísané štruktúry databáz u oboch projektov a taktiež je predstavený online nástroj umožňujúci prehľadávanie a sťahovanie ich dát. Následne je prevedená štatistická, populačná a bioinformatická analýza štrukturálnych variácií produkovaných 3 fázou 1000 Genomes projektu.en
dc.description.abstractThe whole-Genome sequencing and its variations discovery were challenging for many years. The knowledge of all genetic variations is remarkably beneficial in disease research. The bachelor thesis is dedicated to human genetic variations and its two main research projects, the HapMap Project and the 1000 Genomes Project which notably helped the disease analyses. The first part describes both Projects and the following part explains the structure of their databases and presents software which enables to browse and download data from these projects. At last, statistical, population and bioinformatic analyses are performed on structural variant dataset assembled by the 1000 Genomes Project.cs
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationPAROBKOVÁ, V. Bioinformatická analýza jednonukleotidových polymorfismů v databázi 1000 Genomes Project [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.cs
dc.identifier.other126718cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/190315
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNA variácieen
dc.subjectpolymorfizmusen
dc.subjecthaplotypen
dc.subjectHapMap Projecten
dc.subject1000 Genomes Projecten
dc.subjectgenotypovanieen
dc.subjectsekvenovanieen
dc.subjectVCFen
dc.subjectgénen
dc.subjectDNA variationscs
dc.subjectpolymorphismcs
dc.subjecthaplotypecs
dc.subjectHapMap Projectcs
dc.subject1000 Genomes Projectcs
dc.subjectgenotypingcs
dc.subjectsequencingcs
dc.subjectVCFcs
dc.subjectgenecs
dc.titleBioinformatická analýza jednonukleotidových polymorfismů v databázi 1000 Genomes Projecten
dc.title.alternativeBioinformatic analysis of single nucleotide polymorphisms in the 1000 Genomes Project databasecs
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2020-06-23cs
dcterms.modified2020-06-25-09:17:26cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid126718en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 11:59:47en
sync.item.modts2021.11.12 10:55:18en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.58 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
3.19 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_126718.html
Size:
8.1 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_126718.html
Download
Collections
2020