Porovnání metod pro konstrukci barevných DNA spektrogramů

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jiří Rozman, CSc. (místopředseda) Ing. Martin Vítek, Ph.D. (člen) RNDr. Petr Fuchs, Ph.D. (člen) prof. Pharm.Dr. Petr Babula, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. položil otázky: Šlo by potlačit pozadí u spektrogramu z FT změnou barevný mapy? Vysvětlete, co znamená posun okna 0. Jaké parametry má AR model? Jak jste určovala rád AR modelu? Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na položené otázky.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorKubicová, Vladimíracs
dc.contributor.authorPostránecká, Terezacs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractTato práce pojednává o možnostech konstrukce barevných DNA spektrogramů a o vzorech, které z nich detekujeme. Spektrogramy jako nástroje spektrální analýzy nám umožňují současný pohled na lokální frekvence napříč celou nukleotidovou sekvencí. Jsou vhodné pro identifikaci genů či jejich regionů, určování globálních vlastností celých chromozomů, ale také dávají možnost objevit nové dosud neznámé regiony s potenciálním významem. Za účelem takovéto analýzy DNA lze použít techniky číslicového zpracování signálů. Jejich použití však musí předcházet metody konvertování DNA sekvence do numerické reprezentace. Výběr správné numerické reprezentace ovlivní, jak dobře budou dané biologické vlastnosti reflektovány v numerickém zápisu potřebném pro další použití v analýze zpracování signálů.cs
dc.description.abstractThis thesis discusses about possibilities of construction colour DNA spectrograms and about patterns which can be detected there. Spectrograms as tools of spectral analysis give us a simultaneous view of the local frequency throughout the nucleotide sequence. They are suitable for gene identification or gene regions identification, determination of global character about whole chromosomes and also give us a chance for the discovery of yet unknown regions of potential significance. For purpose of this kind of DNA analysis is possible to use digital signal processing methods. We can apply them on only after conversion of DNA sequence to numerical representation. Selection of correct numerical representation affects how well will be reflected biological features in numerical record which we need for another use in digital signal analysis.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationPOSTRÁNECKÁ, T. Porovnání metod pro konstrukci barevných DNA spektrogramů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other65502cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/25943
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNA sekvencecs
dc.subjectnumerická reprezentacecs
dc.subjectspektrogramcs
dc.subjectFourierova transformacecs
dc.subjectautoregresní modelcs
dc.subjectDNA sequenceen
dc.subjectnumerical representationen
dc.subjectspectrogramen
dc.subjectFourier transformen
dc.subjectautoregressive modelen
dc.titlePorovnání metod pro konstrukci barevných DNA spektrogramůcs
dc.title.alternativeComparison of methods for RGB spectrogram construction of DNAen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-12cs
dcterms.modified2013-06-14-10:16:37cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid65502en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:07:51en
sync.item.modts2025.01.15 17:32:54en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
5.42 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
6.53 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_65502.html
Size:
4.37 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_65502.html
Download
Collections
2013