POSTRÁNECKÁ, T. Porovnání metod pro konstrukci barevných DNA spektrogramů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.
Študentka pristupovala k riešeniu diplomovej práce aktívne. Pravidelne využívala konzultácie a aktívne taktiež vyhľadávala literárne zdroje, ktorých je k rozoberanej problematike pomerne málo. Diplomantka sa v práci sa zamerala na optimalizáciu metód na konštrukciu spektrogramov, s ohľadom na čo najlepšie zviditeľnenie vzorov vyskytujúcich sa v spektrograme – CpG ostovčekov, tandemových repetícii a kódujúcich regiónov DNA. Prínosom práce je množstvo inovatívnych krokov pre dosiahnutie lepšej čitateľnosti spektrogramu, napríklad normalizácia dát v rámci spektra z jedného okna. Navyše, práca je napísaná veľmi podrobne, detailne je vysvetlený vplyv rôznych nastavení na výsledný spektrogram, preto je práca vhodným podkladom pre ďalšie štúdie, napríklad pre automatickú detekciu vzorov zo spektrogramov.
Studentka Tereza Reichlová se ve své práci zabývala bioinformatickými metodami pro konverzi DNA sekvencí do numerické podoby a možnostmi analýzy konvertovaných sekvencí nástroji číslicového zpracování signálů. Text práce je v rozsahu 90 stran a obsahuje seznam 34 relevantních odborných pramenů. Po formální stránce je práce standardně zpracovaná, úprava textu, popisy obrázků a číslování jsou akceptovatelné. Jednotlivé kapitoly jsou logicky řazeny. Nevhodně je řešen pouze smíšený popis spektrální analýzy a vzorů DNA sekvencí v kapitole 4, což by mělo být rozděleno do zvláštních kapitol. Ve vlastním textu jsou občasně použity poněkud neodborné výrazy (např. výkonnostní spektrum). V některých částech je text z odborného hlediska nepřesný, např. nesprávně je uveden rozdíl mezi transformacemi DFT a STFT v kapitole 4.2.2. nebo je uveden neexistující vztah mezi 4D a 3D numerickou reprezentací DNA v kapitole 3.1.2. Latinské pojmenování rodu a druhu živočichů se píše vždy s velkým počátečním písmene a kurzívou. V legendě některých obrázků se vyskytuje text "posun okna 0", přičemž není jasné, co znamená nulový posun okna u STFT. Na práci oceňuji rozsah části řešení, kdy byla otestována řada metod pro konverzi sekvencí a jejich spektrální analýzu se zevrubným vyhodnocením grafických výstupů. Výsledky jsou užitečné a lze na ně navázat.
eVSKP id 65502