Identifikace neznámých bakteriálních genomů pomocí online databázového nástroje

Simple item page
but.committeeprof. Pharm.Dr. Petr Babula, Ph.D. (předseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (místopředseda) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen) Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Dr. Vítková se doptala obrázek s výsledky. Kolik je falšně pozitivních/negativních výsledků? Dr. Vítková se dále doptala na detekci celogenomovou, jak byla provedena? Jaký je tedy praktický užitek této aplikace? Dr. Jakubíček se zeptal, co je myšleno průnikem metod? Na ose y v prezentaci máte "Hodnota", co to znamená? Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSchwarzerová, Janacs
dc.contributor.authorNejezchlebová, Juliecs
dc.contributor.refereeČejková, Darinacs
dc.date.created2024cs
dc.description.abstractDiplomová práce se zabývá vytvořením automatického softwarového nástroje Bacterial Explorer, který umožňuje odhalení nových bakterií za pomoci dostupných bioinformatických nástrojů. Nástroj je vytvořen v souladu s požadavky Výzkumného ústavu veterinárního lékařství (VÚVeL) a je testován na datech z poskytnuté VÚVeL databáze. Teoretická část je věnována popisu bakteriální typizace, metodám, které se používají pro genomickou analýzu a již dostupným nástrojům pro bakteriální typizaci. V praktické části se práce zaměřuje na implementaci automatického softwarového nástroje s názvem Bacterial Explorer zahrnující popis nástrojů na pozadí vytvořeného nástroje, uživatelské prostředí a implementaci do online databáze VÚVeL. V poslední části se praktická část zabývá testováním nástroje a diskusí výsledků.cs
dc.description.abstractThis master's thesis deals with the develop of an automatic software tool - Bacterial Explorer which allows the discovery of unknown bacteria using available bioinformatics tools. The tool is developed in accordance with the requirements of the Veterinary Research Institute (VRI) and is tested on data from the provided VRI database. The theoretical part is dedicated to the description of bacterial typing, methods used for genomic analysis, and already available tools for bacterial typing. In the practical part, the thesis focuses on the implementation of the automatic software tool called Bacterial Explorer, including a description of the tools behind the created tool, the user interface and implementation in the online database of VRI . The final part of the practical section deals with tool testing and discussion of the results.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationNEJEZCHLEBOVÁ, J. Identifikace neznámých bakteriálních genomů pomocí online databázového nástroje [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2024.cs
dc.identifier.other159761cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/246228
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectBakteriecs
dc.subjectBioinformatikacs
dc.subjectGenomická analýzacs
dc.subjectVÚVeL (Výzkumný ústav veterinárního lékařství)cs
dc.subjectBacterial Explorercs
dc.subjectBacteriaen
dc.subjectBioinformaticsen
dc.subjectGenomic Analysisen
dc.subjectVRI (Veterinary Research Institute)en
dc.subjectBacterial Exploreren
dc.titleIdentifikace neznámých bakteriálních genomů pomocí online databázového nástrojecs
dc.title.alternativeIdentification of unknown bacterial genomes using an online database toolen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2024-06-10cs
dcterms.modified2024-06-11-09:05:48cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid159761en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 14:42:24en
sync.item.modts2025.01.16 00:16:04en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
5.08 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
271.15 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_159761.html
Size:
9.79 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_159761.html
Download
Collections
2024