Metagenomická analýza vývoje střevního mikrobiomu dětí

but.committeeprof. Ing. Martin Černý, Ph.D. (předseda) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (místopředseda) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen) Ing. Jiří Sekora, MBA (člen) doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Sekora položil otázku ohledně významu pojmu "čtení na vzorek". Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBartoň, Vojtěchcs
dc.contributor.authorZourková, Terezacs
dc.contributor.refereeVítková, Helenacs
dc.date.created2023cs
dc.description.abstractPráce pojednává o vlivu metagenomu na vývoj dítěte a o důvodech přínosnosti zkoumání následků změn lidského střevního mikrobiomu. Následně je v práci nastíněna obecná problematika mikrobiomu a historie jeho studií. Také je zde popsáno složení lidského mikrobiomu střev a souvislosti s imunitním systémem nebo například produkcí hormonů. Rovněž práce obsahuje informace o vybraných metodách analýzy metagenomu, konkrétně mikroskopické metody využívající předchozí kultivaci, hmotnostní spektrometrie a metody sekvenační. Je zde popsán také postup analýzy dat pomocí dostupných bioinformatických nástrojů, kterými byla data vhodně předzpracována. Takto vyfiltrovaná data byla připravena pro navazující profilaci metagenomu, která je v práci podrobně popsána. Na závěr práce jsou vyhodnoceny výsledky profilace, na základě kterých jsou odhadnuty průběhy změn mikrobiomu během vývoje dítěte, což je hlavním cílem této bakalářské práce.cs
dc.description.abstractThe thesis is focused on the influence of the metagenome on child growth and the reasons for the usefulness of investigating the consequences of changes in the human intestinal microbiome. It also describes the general problematics of the microbiome and the history of its studies. The composition of the human intestinal microbiome and the connection with the immune system or, for example, hormone production, are also described here. The thesis also contains information on some methods of metagenome analysis, namely microscopic methods using previous cultivation, mass spectrometry and sequencing methods. The data analysis procedure using various bioinformatics software, with which the data were appropriately pre-processed, is also described here. Filtered data in this way are ready for the following metagenome profiling, which is also described here. At the end of the thesis, the profiling results are evaluated, based on which the course of changes in the microbiome during the aging of the child are estimated, which is the main goal of this bachelor's thesis.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationZOURKOVÁ, T. Metagenomická analýza vývoje střevního mikrobiomu dětí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.cs
dc.identifier.other150837cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/210847
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectmetagenomcs
dc.subjectmikrobiomcs
dc.subjectmikrobiotacs
dc.subjectlidský střevní mikrobiomcs
dc.subjectmikroskopiecs
dc.subjectampliconcs
dc.subjectsekvenovánícs
dc.subjectshotguncs
dc.subjectMultiQCcs
dc.subjectfastpcs
dc.subjectQIIME2cs
dc.subjectbioinformaticsen
dc.subjectmetagenomeen
dc.subjectmicrobiomeen
dc.subjectmicrobiotaen
dc.subjecthuman intestinal microbiomeen
dc.subjectmicroscopyen
dc.subjectampliconen
dc.subjectsequencingen
dc.subjectshotgunen
dc.subjectMultiQCen
dc.subjectfastpen
dc.subjectQIIME2en
dc.titleMetagenomická analýza vývoje střevního mikrobiomu dětícs
dc.title.alternativeMetagenomic analysis of child gut microbiomaen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2023-06-14cs
dcterms.modified2023-06-16-08:34:01cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid150837en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.17 16:27:26en
sync.item.modts2025.01.15 16:50:58en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
10.35 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
2.72 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_150837.html
Size:
6.79 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_150837.html
Collections