Detekce mobilních genetických elementů pomocí číslicového zpracování genomických signálů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda) doc. RNDr. Jaromír Baštinec, CSc. (místopředseda) doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen) Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Odstrčilík: Co jsou to báze? Jak jsou reprezentovány? Vy jste vytvořila detektor, který dokáže detekovat mobilní elementy. Co se myslí větou "nebyl nalezen společný příznak"? RNDr. Masařík: Jaké jiné typy analýz se používají pro hledání MGE? Doc. Kozumplík: IS1541A je konkrétní sekvence čísel kterou hledáte? Používáte korelaci? Studentka obhájila magisterskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorVítková, Helenacs
dc.contributor.authorNováková, Jarmilacs
dc.contributor.refereeSedlář, Karelcs
dc.date.created2017cs
dc.description.abstractPráce se zabývá mobilními genetickými elementy. Je zaměřena na jejich vlastnosti využitelné pro jejich detekci. Zároveň se věnuje problematice transformace symbolické sekvence do numerické formy. Jsou vysvětleny klasifikace mobilních genetických sekvencí, popsány základní typy mobilních genetických sekvencí, principy numerických map a detekce v symbolické reprezentaci Je zpracována konverze symbolických genetických sekvencí dle zvolené numerické mapy a provedena analýza vlastností mobilních genetických elementů v numerické reprezentaci pro návrh detektoru. Na závěr je vytvořena knihovna motivů používaná navrženým detektorem.cs
dc.description.abstractMobile genetic elements are occupied by this project. It is aimed at their features, which can be used for their detection. It also deals with issue of conversion of symbolic sequence into numerical form. Classifications of mobile genetic elements are explained, basic types of mobile genetic sequences are described, and principles of numerical maps and detection in symbolic represetation are also clarified. Conversion of symbolic genetical sequences by chosen numerical map and calculation of normalized correlation values for set of mobile genetic elements are compiled. Analysis of the mobile genetic elements properties is performed for design of detector. The library of themes is created at the end for usage by designed detector.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationNOVÁKOVÁ, J. Detekce mobilních genetických elementů pomocí číslicového zpracování genomických signálů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.cs
dc.identifier.other102371cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/65478
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMobilní genetické elementycs
dc.subjectbakteriecs
dc.subjectinzerční sekvencecs
dc.subjecttranspozoncs
dc.subjectnumerické reprezentacecs
dc.subjectdetektorcs
dc.subjectMobile genetic elementsen
dc.subjectbacteriaen
dc.subjectinsertion sequencesen
dc.subjecttransposonen
dc.subjectnumerical representationen
dc.subjectdetectoren
dc.titleDetekce mobilních genetických elementů pomocí číslicového zpracování genomických signálůcs
dc.title.alternativeMobile genetic elements detection by genomic signal processingen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2017-06-06cs
dcterms.modified2017-06-08-15:30:27cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid102371en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:27:55en
sync.item.modts2025.01.15 17:57:05en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.52 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.rar
Size:
8.05 MB
Format:
Unknown data format
Description:
appendix-1.rar
Download
Thumbnail Image
Name:
review_102371.html
Size:
6.79 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_102371.html
Download
Collections
2017