Metody predikce aktivních míst v proteinech
Loading...
Date
Authors
Duras, Jan
Advisor
Referee
Mark
D
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
ORCID
Abstract
Diplomová práce se zabývá metodami vyhledávání aktivních míst v proteinech. V teoretické části je popsáno složení proteinových rozhraní jako i aktivních míst. Jsou zde uvedeny základní principy vyhledávání aktivních míst. V praktické části je vybraná metoda, využívající S-Transformaci, navržena do pseudokódu a následně implementována do programového prostředí Matlab. Program je po té ověřen na souboru vybraných dat a porovnán s dostupnými metodami.
This master's thesis deals with prediction of hot spots in proteins. The theorethical part describes compositions of proteins interfaces and hot spots. There are mentioned basic principles of hot spots prediction. In the practical part is selected method, using the S-Transform, designed to pseudocode and then implmented to Matlab software. Created program is tested on a sample of data and compared with available methods.
This master's thesis deals with prediction of hot spots in proteins. The theorethical part describes compositions of proteins interfaces and hot spots. There are mentioned basic principles of hot spots prediction. In the practical part is selected method, using the S-Transform, designed to pseudocode and then implmented to Matlab software. Created program is tested on a sample of data and compared with available methods.
Description
Keywords
Protein , aktivní místo , EIIP , rozhraní , interakce , S-Transformace , Protein , hot spots , EIIP , inerface , interaction , S-Transfom
Citation
DURAS, J. Metody predikce aktivních míst v proteinech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2012.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika
Comittee
prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda)
prof. Pharm.Dr. Petr Babula, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Jaromír Baštinec, CSc. (člen)
Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2012-06-07
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Doc. Kolářová položila otázku: popište S transformaci, jaký je vzorec? Jak probíhá zarovnání sekvencí na stejné délky?
Student obhájil diplomovou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena