Mobilní aplikace pro zpracování obrazu elektroforetického gelu
Loading...
Date
Authors
Mojžišová, Anna
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Analýza obrazů 1D gelové elektroforézy je klíčovým krokem ve výzkumu molekulární biologie a umožňuje identifikaci a kvantifikaci proteinů, fragmentů DNA a dalších molekul. Tradiční proces analýzy však může být časově náročný a vyžaduje specializovaný software a vybavení. Tato bakalářská práce představuje nové řešení tohoto problému zavedením mobilní aplikace, která pomáhá při analýze obrazů 1D gelové elektroforézy. Aplikace poskytuje uživatelsky přívětivé rozhraní a sadu výkonných nástrojů pro zpracování obrazu, , segmentaci drah, detekci proužků a aproximaci molekulové hmotnosti. Navrhované metody byly podrobně testovány na sadě různých gelových snímků a výsledky ukazují, že aplikace dokáže přesně a efektivně analyzovat elektroforetické snímky. Přenosnost aplikace umožňuje výzkumným pracovníkům provádět analýzy na cestách, čímž se snižuje čas a náklady spojené s tradičními metodami analýzy. Tato mobilní aplikace představuje pohodlný a praktický nástroj pro výzkumné pracovníky i lékaře, díky němuž je analýza elektroforetických obrazů dostupnější a efektivnější.
The analysis of 1D gel electrophoresis images is a crucial step in molecular biology research, as it allows the identification and quantification of proteins, DNA fragments, and other molecules of interest. However, the traditional analysis process can be time-consuming and requires specialized software and equipment. This paper presents a novel solution to this problem by introducing a mobile application that assists in the analysis of 1D gel electrophoresis images. The application provides a user-friendly interface and a set of powerful tools for image processing, band detection, lane segmentation, and molecular weight approximation. The designed methods were extensively tested using a dataset of diverse gel images, and the results show that the application can accurately and efficiently analyze electrophoresis images. The portability of the application allows researchers to perform analyses on the go, reducing the time and cost associated with traditional analysis methods. This mobile application provides a convenient and practical tool for researchers and clinicians alike, making the analysis of electrophoresis images more accessible and efficient.
The analysis of 1D gel electrophoresis images is a crucial step in molecular biology research, as it allows the identification and quantification of proteins, DNA fragments, and other molecules of interest. However, the traditional analysis process can be time-consuming and requires specialized software and equipment. This paper presents a novel solution to this problem by introducing a mobile application that assists in the analysis of 1D gel electrophoresis images. The application provides a user-friendly interface and a set of powerful tools for image processing, band detection, lane segmentation, and molecular weight approximation. The designed methods were extensively tested using a dataset of diverse gel images, and the results show that the application can accurately and efficiently analyze electrophoresis images. The portability of the application allows researchers to perform analyses on the go, reducing the time and cost associated with traditional analysis methods. This mobile application provides a convenient and practical tool for researchers and clinicians alike, making the analysis of electrophoresis images more accessible and efficient.
Description
Citation
MOJŽIŠOVÁ, A. Mobilní aplikace pro zpracování obrazu elektroforetického gelu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
en
Study field
bez specializace
Comittee
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda)
Ing. Martin Mézl, Ph.D. (místopředseda)
Ing. Jiří Sekora, MBA (člen)
MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen)
Ing. Martin Králík (člen)
Date of acceptance
2023-06-15
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Studentka odpověděla na otázky oponenta. Prof. Penhaker se doptal, co je to 1D gelová elektroforéza? Doptal se na velikost elektroforetického gelu a proč má dané rozměry? Ing. Harabiš se doptal, proč byl využit systém klient-server? Jaké balíčky jste využila pro zpracování obrazu? Ing. Sedlář se doptal na zabezpečení serveru a kde server běží. Prof. Nováková se zeptala na využití aplikace. Ing. Sedlář se zeptal na jakých gelech byla aplikace testována.
Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení