Rentgenová počítačová tomografie embrya myši
Loading...
Date
Authors
Šejnohová, Marie
ORCID
Advisor
Referee
Mark
B
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Jedním z cílů diplomové práce je porovnání možností dostupných mikro-CT. Teoretická část se zabývá možnostmi barvení měkkých tkání a embryí z důvodu zvýšení kontrastu mikro-CT snímků u těchto tkání. Dále se zde popisují zdroje záření a detektory dostupných mikro-CT systémů. V praxi bylo realizováno barvení embrya ve spolupráci s Ústavem embryologie a histologie v Brně. Následně proběhlo skenování na stanici v Brně na FSI, v Praze na ČVUT a synchrotronu Elettra v Itálii. V práci jsou popsána měření embrya myši pomocí výše uvedených zařízení a výsledky porovnány. Nejlepších výsledků bylo dosaženo na mikro-CT v Brně, kde se využívá rentgenová trubice a flat panel detektor. Tyto snímky se použily pro segmentaci chrupavčité tkáně čichového ústrojí pomocí metody 3D region growing. Z výsledných dat byly vytvořeny 3D modely za účelem porovnání s manuálně segmentovaným modelem. Poloautomatickou segmentací se dosahuje méně přesných výsledků, ale z hlediska časové náročnosti je tato metoda vhodnější.
The aim of this semestral thesis is to compare the possibilities of available micro-CT systems. Theoretic part of this thesis there deals with possibilities of staining soft tissues and embryos because of enhancement the contrast of micro-CT images. Here follows a description of sources X-ray and detectors of available micro-CT systems. In practice there was realized the staining of embryo in cooperation with Department of histology and embryology in Brno. Then followed a measuring on FSI in Brno, ČVUT in Prague and synchrotron Elettra in Italy. In semestral thesis are described of the thesis there are compared the micro-CT systems and results of measuring embryos by means of presented systems and results are compared.The best results were obtained on micro-CT in Brno, where X-ray tube and flat panel detector were used. This images were used for a segmentation of cartilage olfactory system by means of 3D region growing. From results they were created 3D models for comparison with a manually segmented model. A less accurate results were obtain with the semi-automatic segmentation but this method isn’t too time-consuming.
The aim of this semestral thesis is to compare the possibilities of available micro-CT systems. Theoretic part of this thesis there deals with possibilities of staining soft tissues and embryos because of enhancement the contrast of micro-CT images. Here follows a description of sources X-ray and detectors of available micro-CT systems. In practice there was realized the staining of embryo in cooperation with Department of histology and embryology in Brno. Then followed a measuring on FSI in Brno, ČVUT in Prague and synchrotron Elettra in Italy. In semestral thesis are described of the thesis there are compared the micro-CT systems and results of measuring embryos by means of presented systems and results are compared.The best results were obtained on micro-CT in Brno, where X-ray tube and flat panel detector were used. This images were used for a segmentation of cartilage olfactory system by means of 3D region growing. From results they were created 3D models for comparison with a manually segmented model. A less accurate results were obtain with the semi-automatic segmentation but this method isn’t too time-consuming.
Description
Citation
ŠEJNOHOVÁ, M. Rentgenová počítačová tomografie embrya myši [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika
Comittee
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda)
prof. Pharm.Dr. Petr Babula, Ph.D. (místopředseda)
doc. RNDr. Jiří Tomáš, Dr. (člen)
Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen)
Ing. Marina Filipenská, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2015-06-09
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky a odpověděla na otázky členů komise a oponenta. Studentka obhájila bakalářskou práci.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení