Metody analýzy pangenomu u bakteriálních populací

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Daniel Novák, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (místopředseda) Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen) Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen) MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen) Ing. Martin Králík (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Němcová se ptá na porovnání algoritmu s ostatními algortimy. Jak vznikl redukovaný dataset? Dají se výsledky generalizovat? MUDr. Jurajda se ptá jestli je výpočet náročný i na servrovém úložišti? Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykslovenština (Slovak)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorNykrýnová, Markétask
dc.contributor.authorLorková, Ema Martask
dc.contributor.refereeŠkutková, Helenask
dc.date.accessioned2022-06-16T06:52:10Z
dc.date.available2022-06-16T06:52:10Z
dc.date.created2022cs
dc.description.abstractTáto bakalárska práca sa zaoberá analýzou pangenómu u bakteriálnych populácií. V prvej časti je opísaný genóm, pseudogény, baktérie vrátane ich genómu, pangenóm a jeho súčasti. Uvedený je popis štyroch vybraných nástrojov na analýzu pangenómu. V praktickej časti je prevedené testovanie týchto nástrojov a porovnanie ich výstupov pre genóm danej baktérie. Nakoniec je navrhnutý algoritmus pre vlastnú metódu analýzy, opísaný je vlastný program a získané výsledky.sk
dc.description.abstractThis bachelor thesis deals with pan-genome analysis for bacterial populations. The first part specifies genome, pseudogenes, bacteria and its genome, and pan-genome including its components. Following part introduces four tools for pan-genome analysis. Testing of these tools against specific bacterial genome and their comparison is mentioned in practical part. Lastly, an algorithm is implemented for creating new pipeline, and a code and obtained results are described.en
dc.description.markDcs
dc.identifier.citationLORKOVÁ, E. Metody analýzy pangenomu u bakteriálních populací [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2022.cs
dc.identifier.other142072cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/205741
dc.language.isoskcs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectanalýza pangenómusk
dc.subjectgenómsk
dc.subjectbaktériask
dc.subjectpan-genome analysisen
dc.subjectgenomeen
dc.subjectbacteriaen
dc.titleMetody analýzy pangenomu u bakteriálních populacísk
dc.title.alternativeBacterial Pan-Genome Analysisen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2022-06-15cs
dcterms.modified2022-06-15-13:44:25cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid142072en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2022.06.16 08:52:10en
sync.item.modts2022.06.16 08:15:44en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
5.43 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
1.13 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_142072.html
Size:
5.81 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_142072.html
Download
Collections
2022