but.committee	prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. RNDr. Alexandr Meduna, CSc. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. William Steingartner, Ph.D. (člen) doc. Ing. František Zbořil, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázku oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " C ". Otázky u obhajoby: S jakými parametry bylo dosaženo nejlepší podobnosti s referenční sadou shluků s pomocí nástroje FitClust?	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Martínek, Tomáš	cs
dc.contributor.author	Kubiš, Radim	cs
dc.contributor.referee	Burgetová, Ivana	cs
dc.date.created	2015	cs
dc.description.abstract	Jedním z hlavních důvodů, proč se proteinové sekvence shlukují, je predikce jejich struktury, funkce a evoluce. Mnoho současných nástrojů má nevýhodu ve velké výpočetní náročnosti, protože zarovnává každou sekvenci s každou. Pokud některý nástroj pracuje výrazně rychleji, nedosahuje oproti ostatním takové přesnosti. Další z nevýhod je zpracování na vyšších mírách podobnosti, ale homologní proteiny si mohou být podobné i méně. Proces shlukování také bývá ukončen při dosažení určité podmínky, která však nezohledňuje dostatečnou kvalitu shluků. Diplomová práce se zabývá návrhem a implementací nového nástroje pro shlukování proteinových sekvencí. Nový nástroj by měl být výpočetně nenáročný, se zachováním požadované přesnosti, a produkovat kvalitnější shluky. Práce dále popisuje testování navrženého nástroje, zhodnocení dosažených výsledků a možnosti dalšího rozvoje.	cs
dc.description.abstract	One of the main reasons for protein clustering is prediction of structure, function and evolution. Many of current tools have disadvantage of high computational complexity due to all-to-all sequence alignment. If any tool works faster, it does not reach accuracy as other tools. Further disadvantage is processing on higher rate of similarity but homologous proteins can be similar with less identity. The process of clustering often ends when reach the condition which does not reflect sufficient quality of clusters. Master's thesis describes the design and implementation of new tool for clustering of protein sequences. New tool should not be computationally demanding but it should preserve required accuracy and produce better clusters. The thesis also describes testing of designed tool, evaluation of results and possibilities of its further development.	en
dc.description.mark	C	cs
dc.identifier.citation	KUBIŠ, R. Shlukování biologických sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2015.	cs
dc.identifier.other	88628	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/52296
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	Shlukování	cs
dc.subject	biologická sekvence	cs
dc.subject	protein	cs
dc.subject	porovnání	cs
dc.subject	podobnost	cs
dc.subject	hierarchie	cs
dc.subject	bioinformatika	cs
dc.subject	Clustering	en
dc.subject	biological sequence	en
dc.subject	protein	en
dc.subject	comparison	en
dc.subject	similarity	en
dc.subject	hierarchy	en
dc.subject	bioinformatics	en
dc.title	Shlukování biologických sekvencí	cs
dc.title.alternative	Clustering of Biological Sequences	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	masterThesis	en
dc.type.evskp	diplomová práce	cs
dcterms.dateAccepted	2015-06-22	cs
dcterms.modified	2020-05-10-16:12:02	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	88628	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.26 15:20:03	en
sync.item.modts	2025.01.17 11:47:58	en
thesis.discipline	Bioinformatika a biocomputing	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů	cs
thesis.level	Inženýrský	cs
thesis.name	Ing.	cs

Shlukování biologických sekvencí

Files

Original bundle

Collections