Celogenomové zarovnání pomocí suffixových stromů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (místopředseda) doc. RNDr. Martin Kovár, Ph.D. (člen) Ing. Marina Filipenská, Ph.D. (člen) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Maděránková položila otázku: Co to jsou treponemy? Doc. Kolář položil otázku: Jak je možné zrychlit navržený algoritmus? Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorKlouba, Lukášcs
dc.contributor.refereeSedlář, Karelcs
dc.date.created2017cs
dc.description.abstractCílem této práce je vytvořit algoritmus, který pomocí sufixových konstrukcí umožní zarovnání genomu dvou organismů, a implementovat jej do programového prostředí jazyka R. Práce se věnuje popisu konstrukce sufixových struktur a metodami celogenomového zarovnání. Výsledkem práce je funkční algoritmus pro celogenomové zarovnání pomocí sufixových struktur implementovaný v programovém prostředí R a jeho srovnání s podobnými programy pro celogenomové zarovnání.cs
dc.description.abstractThe aim of this thesis is to create an algorithm that allows the alignment of the genome of two organisms by means of suffix structures and to implement it into the programming language environment R. The thesis deals with the description of the construction of the suffix structures and the methods of whole genome alignment. The result of the thesis is a functional algorithm for whole genome alignment by means of suffix structures implemented in the software environment R and its comparison with similar programs for the whole genome alignment.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationKLOUBA, L. Celogenomové zarovnání pomocí suffixových stromů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.cs
dc.identifier.other102362cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/65466
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectsufixové stromycs
dc.subjectsufixová polecs
dc.subjectUkkonenův algoritmuscs
dc.subjectRcs
dc.subjectcelogenomové zarovnánícs
dc.subjectsuffix treeen
dc.subjectsuffix arrayen
dc.subjectUkkonen’s algorithmen
dc.subjectRen
dc.subjectwhole-genome alignmenten
dc.titleCelogenomové zarovnání pomocí suffixových stromůcs
dc.title.alternativeWhole genome alignment using suffix treesen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2017-06-06cs
dcterms.modified2017-06-08-15:30:21cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid102362en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:27:46en
sync.item.modts2025.01.15 11:59:56en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.4 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
2.49 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_102362.html
Size:
5.67 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_102362.html
Download
Collections
2017