Využití mikroskopie atomárních sil ke studiu vybraného bakteriálního kmene
| but.committee | prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda) doc. Ing. Filip Mravec, Ph.D. (místopředseda) prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen) doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | 1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem bakalářské práce. 2. Byly přečteny posudky na bakalářskou práci. 3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponentky a na všechny otázky odpověděla v plné šíři. Diskuse: prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. Při měření pomocí AMF, tedy hrot funguje jako skener? Jak byly nanášeny buňky na sklíčko? Jsou buňky pouze v jedné vrstvě? K čemu je možné použít Vámi získané výsledky? Jaký to má aplikační potenciál? doc. Ing. Filip Mravec, Ph.D. V jakém modu AFM jste měřila? Můžete to prosím objasnit? Jakým způsobem se získávala adheze? Jakým způsobem jste volila parametr pro proložení křivek? prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. Jak dlouho trvalo jedno měření, které uvádíte v práci? Kolik měření jste dělala? doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. Má vliv přítomnosti PHA v bakteriích na měření pomocí AFM? doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. V práci uvádíte, že výsledky na GC potvrdily nepřítomnost PHA syntázy, můžete to objasnit? Co bylo měřené pomocí plynové chromatografie? Je možné použít měření povrchu i pro jiné mikroorganismy než pro bakterie? Jaké další aplikace to muže mít? Studentka odpověděla na doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. Studentka prokázala dobré odborné znalosti i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků. | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Chemie pro medicínské aplikace | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Smilek, Jiří | cs |
| dc.contributor.author | Nováková, Simona | cs |
| dc.contributor.referee | Slaninová, Eva | cs |
| dc.date.created | 2024 | cs |
| dc.description.abstract | Předmětem bakalářské práce bylo studium vybraných bakteriálních kmenů prostřednictvím mikroskopie atomárních sil. Zkoumány byly termofilní purpurové bakterie – Rhodobaca Barguzinensis, Rhodoblastus acidophilus. Hlavním cílem bylo optimalizovat vybranou mikroskopickou metodu pro zobrazení ve vodném prostředí s nejvhodnějším výběrem fixace vzorku. Pro studium bakteriálních kmenů bylo nutné zachovat viabilitu buněčných mikroorganismů a dodržet optimální podmínky pro zachování nativního stavu při procesu měření. Dále byly vyhodnoceny mechanické vlastnosti – Youngův modul a adheze. Morfologie jednotlivých vzorků byla srovnávána u vzorků stejného druhu v odlišném pH kapalného prostředí a v prostředích s různou koncentrací rozpuštěné soli NaCl. Cíleno bylo i na schopnost produkce PHA granulí u purpurových bakterií, ovšem kvůli absenci PHA-syntázy první třídy nebylo PHA detekováno. Byly porovnány vlivy různých parametrů kultivace jako odlišná doba kultivace či rozdílné pH prostředí. Snímkování bakterií probíhalo pomocí hrotu SNL-10, který je vhodný pro bakteriální vzorky v kapalném prostředí a samotné měření probíhalo v módu QITM. K imobilizaci byl použit skleněný substrát pokrytý vrstvou Poly-L-lysinu. Na závěr byly vyhodnoceny mechanické vlastnosti prostřednictvím Youngova modulu a adheze u vzorků s různě proměnlivými faktory prostředí. | cs |
| dc.description.abstract | The subject of the bachelor’s thesis was the study of selected bacterial strains by a selected method of atomic force microscopy. Thermophilic purple bacteria – Rhodoblastus acidophilus, Rhodobaca barguzinensis – were investigated. The main aim of this theses was focused on optimizing the usage of this microscopic method for imaging in an aqueous environment with the most appropriate fixation of sample. Focusing on bacterial strains demanded to preserve the viability of microorganisms and to observe optimal conditions for maintaining the native state during the measurement process. Furthermore, mechanical properties were evaluated – Young’s modulus and adhesion. The morphology of individual samples was compared for samples of the same species in different pH liquid environments and in environments with different concentrations of dissolved NaCl salt. The ability to produce PHA granules in purple bacteria was also targeted, however, due to the absence of first-class PHA synthase, PHA was not detected. The effects of different cultivation parameters such as different cultivation time or different pH of the environment were compared. Imaging of bacteria was carried out using the SNL-10 tip, which is suitable for bacterial samples in a liquid environment, and the measurement itself was carried out in QITM mode. A glass substance covered with a layer of Poly-L-lysin was used for immobilization. Finally, the mechanical properties were evaluated through Young’s modulus and adhesion for samples with various environmental factors. | en |
| dc.description.mark | C | cs |
| dc.identifier.citation | NOVÁKOVÁ, S. Využití mikroskopie atomárních sil ke studiu vybraného bakteriálního kmene [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2024. | cs |
| dc.identifier.other | 156933 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/246422 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Mikroskopie atomárních sil | cs |
| dc.subject | Rhodoblastus acidophilus | cs |
| dc.subject | Rhodobaca barguzinensis | cs |
| dc.subject | polyhydroxyalkanoáty | cs |
| dc.subject | extremofilní purpurové bakterie | cs |
| dc.subject | Atomic force microscopy | en |
| dc.subject | Rhodoblastus acidophilus | en |
| dc.subject | Rhodobaca barguzinensis | en |
| dc.subject | polyhydroxyalkanoates | en |
| dc.subject | extremophilic purple bacteria | en |
| dc.title | Využití mikroskopie atomárních sil ke studiu vybraného bakteriálního kmene | cs |
| dc.title.alternative | The utilization of atomic force miscroscopy to study of selected bacterial strain | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2024-06-10 | cs |
| dcterms.modified | 2024-06-10-17:53:57 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta chemická | cs |
| sync.item.dbid | 156933 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.16 12:57:34 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 22:00:20 | en |
| thesis.discipline | bez specializace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav fyzikální a spotřební chemie | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |