Segmentácia Bielych Krviniek s Použitím Plne Konvolučných Neurónových Sietí
Loading...
Date
2018-10-31
Authors
Hesko, Branislav
Harabiš, Vratislav
Králík, Martin
ORCID
Advisor
Referee
Mark
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
International Society for Science and Engineering, o.s.
Abstract
In medicine, the identification and counting of white blood cells are used for diagnosing diseases like inflammation, malignancy or leukaemia. In this paper, we propose a novel approach to white blood cell segmentation. On two different white blood cell datasets, two networks, PSPNet and U-Net are trained to perform simultaneous nucleus and cytoplasm segmentation. Compared to ground truth, our segmentations are almost identical, with smoother borders. When comparing overall cell segmentation with current methods, our networks are achieving similar (or better) results in evaluated metrics, with intersection over union reaching around 0.95 for both networks. DICE coefficient is higher than 0.96 for both networks and both datasets, which is a promising result of the segmentation.
V medicine sú identifikácia a počítanie bielych krviniek používané pre diagnostiku zápalu, malignít alebo leukémie. V tejto práci sme navrhli nový prístup ku segmentácii bielych krviniek. Jadro a cytoplazma buniek sú simultánne segmentované s použitím dvoch natrénovaných neurónových sietí, PSPNet a U-Net, na dvoch databázach obsahujúcich značené obrazy bielych krviniek. V porovnaní so značenými dátami je naša segmentácia skoro identická, s hladšou detekciou hraníc objektov. V prípade porovnania s momentálne používanými metódami dosahujeme podobné (alebo lepšie) výsledky vo vyhodnocovaných metrikách, s podieľom prieniku ku zjednoteniu segmentácií dosahujúcim hodnôt okolo 0.95 pre obe siete. DICE koeficient je vyšší ako 0.96 pre obe siete a obe databázy, čo predstavuje sľubné výsledky segmentácie.
V medicine sú identifikácia a počítanie bielych krviniek používané pre diagnostiku zápalu, malignít alebo leukémie. V tejto práci sme navrhli nový prístup ku segmentácii bielych krviniek. Jadro a cytoplazma buniek sú simultánne segmentované s použitím dvoch natrénovaných neurónových sietí, PSPNet a U-Net, na dvoch databázach obsahujúcich značené obrazy bielych krviniek. V porovnaní so značenými dátami je naša segmentácia skoro identická, s hladšou detekciou hraníc objektov. V prípade porovnania s momentálne používanými metódami dosahujeme podobné (alebo lepšie) výsledky vo vyhodnocovaných metrikách, s podieľom prieniku ku zjednoteniu segmentácií dosahujúcim hodnôt okolo 0.95 pre obe siete. DICE koeficient je vyšší ako 0.96 pre obe siete a obe databázy, čo predstavuje sľubné výsledky segmentácie.
Description
Keywords
Citation
Document type
Peer-reviewed
Document version
Published version
Date of access to the full text
Language of document
en
Study field
Comittee
Date of acceptance
Defence
Result of defence
Document licence
(C) 2018 Elektrorevue