Segmentace amyloidních plaků v mozcích transgenních potkanů na základě mikroCT dat
Loading...
Date
Authors
Kačníková, Diana
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Prítomnosť amyloidných plakov v hipokampuse upozorňuje na výskyt Alzheimerovej choroby. Manuálna segmentácia amyloidných plakov je veľmi časovo náročná a zvyšuje čas, ktorý môže byť využitý na sledovanie distribúcie amyloidných plakov. Distribúcia nesie významné informácie o progrese ochorenia a vplyvu potencionálnej terapie. Automatická alebo poloautomatická segmentačná metóda môže viesť ku značnému ušetreniu času, ktorý je pri rýchlom progrese choroby veľmi potrebný. Táto práca obsahuje popis amyloidných plakov a CT zobrazovacieho systému. V tejto diplomovej práci sú tri implementované algoritmy, dva z nich vychádzajú z publikovaných článkov a jeden je vlastné metodického riešenie. Záverom práce je kvantitatívne vyhodnotenie presnosti implementovaných segmentačných postupov.
The presence of amyloid plaques in the hippocampus highlights the incidence of Alzheimer’s disease. Manual segmentation of amyloid plaques is very time consuming and increases the time that can be used to monitor the distribution of amyloid plaques. Distribution carries significant information about disease progression and the impact of potential therapy. The automatic or semi-automatic segmentation method can lead to significant savings in the time which are required when the disease has rapid progression. The description of amyloid plaques and the computed tomography are included in this work. In this diploma thesis are three implemented algorithms, two of them are based on published articles and one’s own methodological solution. The conclusion of the thesis is a quantitative evaluation of the accuracy of implemented segmentation procedures.
The presence of amyloid plaques in the hippocampus highlights the incidence of Alzheimer’s disease. Manual segmentation of amyloid plaques is very time consuming and increases the time that can be used to monitor the distribution of amyloid plaques. Distribution carries significant information about disease progression and the impact of potential therapy. The automatic or semi-automatic segmentation method can lead to significant savings in the time which are required when the disease has rapid progression. The description of amyloid plaques and the computed tomography are included in this work. In this diploma thesis are three implemented algorithms, two of them are based on published articles and one’s own methodological solution. The conclusion of the thesis is a quantitative evaluation of the accuracy of implemented segmentation procedures.
Description
Citation
KAČNÍKOVÁ, D. Segmentace amyloidních plaků v mozcích transgenních potkanů na základě mikroCT dat [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
sk
Study field
bez specializace
Comittee
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda)
Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (místopředseda)
doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen)
Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2020-06-16
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Doc. Kolář položil otázku, jak konkrétně studentka manuálně data segmentovala. Dále položil otázku na hodnoty v tabulce 3.1 a z jakého důvodu jsou shodné. Dále položil otázku, v čem vidí největší přínos prezentované práce a na počet plaků v jednotlivých vzorcích.
Doc. Masařík položil otázku, na čem konkrétně studentka pracovala v rámci biologické části práce.
Mgr. Ing. Sedlář položil otázku, proč si studentka vybrala toto téma ze základního výzkumu.
Ing. Čmiel položil otázku, jak probíhá připrava vzorků pro mikroskopování.
Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení