Segmentace hipokampu v MRI datech
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Práce se zabývá využitím grafových metod pro segmentaci málo kontrastních obrazových dat, konkrétně pro segmentaci hipokampu ze snímků magnetické rezonance. Nejprve je uvedena základní problematika a terminologie teorie grafů. Následně je popsána me toda minimálního řezu grafem včetně algoritmů schopných tento minimální řez nalézt. Následuje popis její implementace pro segmentaci 2D a 3D obrazových dat. Metoda byla testována na zkušebních datech a poté implemetována jako modul pro software 3D Slicer. Zde byla testována na snímcích hipokampu zdravých pacientů stejně jako na pacientů trpících Alzheimerovou chorobou. Nastíněny jsou nejčastější problémy vyskytující se při segmentaci a možné postupy jejich řešení.
The thesis deals with application of graph-based methods in segmentation of low contrast image data, specifically hippocampus segmentation from magnetic resonance data. Firstly, basics and terminology of graph theory is introduced. Next, minimum graph cut method is explained along with algorithms capable of finding this cut. After that comes the description of its implementation for 2D and 3D image data segmentation. Method was tested on sample data and then implemented as a 3D Slicer software module. Here the method was tested on the hipocampus data of healthy patients as well as patients suffering from Alzheimer’s disease. Most common problems occuring during the segmentation were forshadowed as well as possible ways to solve them.
The thesis deals with application of graph-based methods in segmentation of low contrast image data, specifically hippocampus segmentation from magnetic resonance data. Firstly, basics and terminology of graph theory is introduced. Next, minimum graph cut method is explained along with algorithms capable of finding this cut. After that comes the description of its implementation for 2D and 3D image data segmentation. Method was tested on sample data and then implemented as a 3D Slicer software module. Here the method was tested on the hipocampus data of healthy patients as well as patients suffering from Alzheimer’s disease. Most common problems occuring during the segmentation were forshadowed as well as possible ways to solve them.
Description
Citation
KODYM, O. Segmentace hipokampu v MRI datech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínská technika a bioinformatika
Comittee
doc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda)
Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda)
Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen)
Ing. Martin Vítek, Ph.D. (člen)
doc. Mgr. Vladan Bernard, Ph.D. (člen)
MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2015-06-18
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení