Vizualizace genomických rysů transposonů
| but.committee | prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. RNDr. Jitka Kreslíková, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. Jaroslav Rozman, Ph.D. (člen) doc. Ing. Michal Španěl, Ph.D. (člen) | cs |
| but.defence | Studentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm C. Otázky u obhajoby: Jak náročné by bylo implementovat podporu pro další formáty určené k ukládání informací o DNA? Dokážete odhadnout, jak by se zvětšil potenciální okruh uživatelů? Budete se pokoušet uživatelskou základnu nástroje rozšířit i mimo Biofyzikální ústav? | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Vogel, Ivan | cs |
| dc.contributor.author | Nétková, Barbora | cs |
| dc.contributor.referee | Bendl, Jaroslav | cs |
| dc.date.created | 2014 | cs |
| dc.description.abstract | Tato práce se zabývá vizualizací genomických rysů transposonů. Vstupní soubor k vizualizaci je typu GFF. Tento typ souboru má pevnou definici a v dnešní době je tento typ souboru běžně používaný k popisu genomů. Přestože již existuje několik nástrojů, které vizualizaci z GFF souborů umožňují, volně dostupný nástroj s různými možnostmi vizualizace a snadným ovládáním chybí. Aplikace prezentovaná v této práci má za úkol spojit výhody existujících komerčních produktů s volnou dostupností. K ovládání aplikace slouží grafické uživatelské rozhraní. Aplikace umožňuje snadno nahrát vstupní soubor, vytvořit hierarchicky strukturovaný strom z jednotlivých prvků a následně umožní vizualizaci jednotlivých prvků a jejich vnitřní struktury v pravé části okna aplikace. | cs |
| dc.description.abstract | This thesis deals with visualization of transposons' genomic features. The Genomic feature format (GFF) is an input file to visualisation. This type of file has strict definition and it is nowadays a de-facto standard format for genome description. Although there are several tools for GFF visualization, an open source application with advanced visualization features is missing. This work presents a design of such a tool. The application has a graphical user interface to simplify the user's work and combines the advantages of existing commercial products with free access. The application provides simple way to import user's biological data from a GFF file, creates hierarchical tree of individual elements including a detailed internal structure visualization in a subwindow. | en |
| dc.description.mark | C | cs |
| dc.identifier.citation | NÉTKOVÁ, B. Vizualizace genomických rysů transposonů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2014. | cs |
| dc.identifier.other | 78511 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/56601 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | vizualizace | cs |
| dc.subject | transposony | cs |
| dc.subject | hierarchický strom | cs |
| dc.subject | GFF | cs |
| dc.subject | genomické rysy | cs |
| dc.subject | DNA | cs |
| dc.subject | visualisation | en |
| dc.subject | transposons | en |
| dc.subject | hiararchical tree | en |
| dc.subject | GFF | en |
| dc.subject | genomic features | en |
| dc.subject | DNA | en |
| dc.title | Vizualizace genomických rysů transposonů | cs |
| dc.title.alternative | Visualization of Transposons' Genomic Features | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2014-06-19 | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-09-23:41:51 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 78511 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.18 18:47:53 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 13:09:22 | en |
| thesis.discipline | Informační technologie | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |