Predikce aktivních míst v proteinech

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Jiří Jan, CSc. (předseda) prof. Ewaryst Tkacz, Ph.D.,D.Sc. (místopředseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (člen) Mgr. Dušan Hemzal, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Fajkus položil otázku: Jaké další faktory by se daly použít jako prediktory aktivních míst v proteinech? Prof. Jan položil otázku: Jaké jsou bázové funkce S-transformace? Student obhájil diplomovou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorKašpárek, Jancs
dc.contributor.refereeTkacz, Ewarystcs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractZnalost aktivních míst proteinů a schopnost určit jejich polohu pouze z informace o primární struktuře daného proteinu je dlouhodobým cílem snažení mnoha vědců po celém světě. Tato práce osvětluje význam aktivních míst jako takových a shrnuje pokroky dosažené na poli jejich predikce. Kromě toho je zde představen predikční algoritmus pracující pouze s informacemi z primární struktury proteinů. Jeho základem jsou techniky zpracování signálů. Pro převod na numerický signál je využito veličiny EIIP a další zpracování probíhá pomocí S-transformace. Algoritmus dosahuje senzitivity větší než 60 %, jeho pozitivní prediktivní hodnota přesahuje 50 % a oproti jiným současným metodám vyniká zejména svou rychlostí a jednoduchostí.cs
dc.description.abstractKnowledge of protein hot spots and the ability to successfully predict them while using only primary protein structure has been a worldwide scientific goal for several decades. This thesis describes the importance of hot spots and sums up advances achieved in this field of study so far. Besides that we introduce hot spot prediction algorithm using only a primary protein structure, based primarily on signal processing techniques. To convert protein sequence to numerical signal we use the EIIP attribute, while further processing is carried out via means of S-transform. The algorithm achieves sensitivity of more than 60 %, positive predictive value exceeds 50 % and the main advantage over competitive algorithms is its simplicity and low computational requirements.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationKAŠPÁREK, J. Predikce aktivních míst v proteinech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other65478cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/26148
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectPredikce aktivních místcs
dc.subjectEIIPcs
dc.subjectS-transformacecs
dc.subjectdigitální filtracecs
dc.subjectsekvence proteinucs
dc.subjectRRMcs
dc.subjectHot spots predictionen
dc.subjectactive sitesen
dc.subjectEIIPen
dc.subjectS-transformen
dc.subjectdigital filtersen
dc.subjectprotein sequenceen
dc.subjectRRMen
dc.titlePredikce aktivních míst v proteinechcs
dc.title.alternativeProtein hot spots predictionen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-11cs
dcterms.modified2013-06-14-10:16:28cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid65478en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 13:08:03en
sync.item.modts2025.01.17 13:58:00en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.93 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
111.84 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_65478.html
Size:
3.82 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_65478.html
Download
Collections
2013