Vliv přírodních látek z čaje na G-quadruplexy a vazebné a transaktivační vlastnosti proteinu p53
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Nádorový supresorový protein p53 patří mezi nejdůležitější regulátory buněčného cyklu při poškození DNA. Kromě zástavy buněčného cyklu a navození apoptózy, interaguje protein p53 s jinými proteiny a DNA. Mutace genu TP53 kódující protein p53 jsou společným znakem lidské rakoviny. Tato bakalářská práce zkoumá přírodní látky z čaje, které by mohly hrát pozitivní roli v aktivaci proteinu p53 u nádorových onemocnění a uplatnit se v podpoře léčby těchto onemocnění. V teoretické části bakalářské práce byly popsány sekundární struktury DNA, konkrétně struktura a vlastnosti G-kvadruplexů, dále protein p53 a jeho vazebná aktivita k sekundárním strukturám DNA. Byly popsány vybrané přírodní látky vyskytující se v čajích a potravinách – kyselina gallová a apigenin. Cílem experimentální části této práce bylo ověřit schopnost těchto látek interagovat s G-kvadruplexy in vitro a tím je stabilizovat v kvasinkovém modelu a posoudit následný vliv na intenzitu účinku transkativace proteinu p53. Interakce kvartérních struktur s G4 ligandy byla ověřena in vitro pomocí ThT fluorescenčního testu a luciferázového reportérového testu. Bylo zjištěno, že G4 ligandy o koncentraci 30 M po 20 hodinách inkubace nevykazovaly výraznější vliv na testované kvasinkové kultury. Při koncentraci G4 ligandů 60 M bylo pozorováno navýšení produkce proteinu p53, vlivem buněčného stresu způsobeného přítomností G4 ligandů.
The tumor suppressor protein p53 belongs to the most important regulator of the cell cycle in case of DNA damage. Apart from stopping the cell cycle and inducing apoptosis, protein p53 interacts with other proteins and DNA. Mutation of the TP53 gene encoding the protein p53 are a common feature of human cancer. This Bachelor thesis investigates natural substances from tea which could play a positive role in the activation of protein p53 in cancer and be used to support the treatment of these diseases. In the theoretical part of the Bachelor thesis, the secondary structures of DNA were described, specifically the structure and properties of G-quadruplexes, as well as protein p53 and its binding activity to the secondary structure of DNA. Selected natural substances found in tea and food were described – gallic acid and apigenin. The aim of the experimental part of this work was to verify the ability of these substances to interact with G-quadruplexes in vitro and thus to stabilize them in the yeast model and to assess the subsequent effect on measuring the effect of protein p53 transactivation. The interaction of quaternary structures with G4 ligands was verified in vitro by using the ThT fluorescence assay and the luciferase reporter assay. It was found that G4 ligands at 30 M concentration after 20 hours of incubation did not show a significant effect on the tested yeast cultures. At a 60 M concentration of G4 ligands, an increase in protein p53 production was observed due to cellular stress caused by the presence of G4 ligands.
The tumor suppressor protein p53 belongs to the most important regulator of the cell cycle in case of DNA damage. Apart from stopping the cell cycle and inducing apoptosis, protein p53 interacts with other proteins and DNA. Mutation of the TP53 gene encoding the protein p53 are a common feature of human cancer. This Bachelor thesis investigates natural substances from tea which could play a positive role in the activation of protein p53 in cancer and be used to support the treatment of these diseases. In the theoretical part of the Bachelor thesis, the secondary structures of DNA were described, specifically the structure and properties of G-quadruplexes, as well as protein p53 and its binding activity to the secondary structure of DNA. Selected natural substances found in tea and food were described – gallic acid and apigenin. The aim of the experimental part of this work was to verify the ability of these substances to interact with G-quadruplexes in vitro and thus to stabilize them in the yeast model and to assess the subsequent effect on measuring the effect of protein p53 transactivation. The interaction of quaternary structures with G4 ligands was verified in vitro by using the ThT fluorescence assay and the luciferase reporter assay. It was found that G4 ligands at 30 M concentration after 20 hours of incubation did not show a significant effect on the tested yeast cultures. At a 60 M concentration of G4 ligands, an increase in protein p53 production was observed due to cellular stress caused by the presence of G4 ligands.
Description
Citation
FOLTANOVÁ, K. Vliv přírodních látek z čaje na G-quadruplexy a vazebné a transaktivační vlastnosti proteinu p53 [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biochemická technologie
Comittee
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda)
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (místopředseda)
prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (člen)
prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2023-06-15
Defence
1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem bakalářské práce.
2. Byly přečteny posudky na bakalářskou práci.
3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponentky a na všechny otázky odpověděla v plné šíři.
Diskuse:
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc.
Zabýval se někdo kombinací ligandů? Jaké jiné látky by bylo ještě možné použít? Mohou některé látky rušit nebo omezovat vaznost ligandů na protein? Co přesně dělá protein p53? Vyskytují se v lidském těle i jiné proteiny s podobnou funkcí jako má protein p 53? Čím dochází k aktivaci proteinu p53? Je neustále navázán na DNA? Jak rozpozná, že je DNA poškozená?
Studentka odpověděla na všechny doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. V diskusi studentka prokázala výbornou orientaci v dané problematice. Po diskusi následovalo hodnocení závěrečné práce. Studentka prokázala nejen výborné odborné znalosti, ale i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení