Systém pro vizualizaci dat ze snímků buněk
Loading...
Date
Authors
Černák, Michal
Advisor
Referee
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
ORCID
Abstract
Tato práce se zabývá extrakcí dat ze snímků buněčných preparátů a jejich vizualizací. Snímky jsou zpracované fluorescenční metodou FISH. Práce obsahuje teoretický podklad pro vypracování systému pro podporu automatizace určení diagnózy Turnerova syndromu, diskutuje o možnostech předzpracování a segmentace snímků, následné extrakce vektoru příznaků a vizualizace extrahovaných dat.
This thesis deals with extraction of data from cell images and their visualisation. Cell images are processed by FISH method. It discusses theory of diagnosis evaluation automation and cell features visualization. That concerns image processing, cell nuclei segmentation, feature extraction and data visualization.
This thesis deals with extraction of data from cell images and their visualisation. Cell images are processed by FISH method. It discusses theory of diagnosis evaluation automation and cell features visualization. That concerns image processing, cell nuclei segmentation, feature extraction and data visualization.
Description
Citation
ČERNÁK, M. Systém pro vizualizaci dat ze snímků buněk [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2012.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Počítačová grafika a multimédia
Comittee
prof. Dr. Ing. Jan Černocký (předseda)
prof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (místopředseda)
doc. RNDr. Pavel Hruška, CSc. (člen)
doc. Ing. Přemysl Kršek, Ph.D. (člen)
Ing. Karel Masařík, Ph.D. (člen)
Ing. Josef Strnadel, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2012-06-15
Defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm C. Otázky u obhajoby: V sekcii o detekcii signálov spomínate, že algoritmus niekedy detekuje aj viac než dva signály, prípadne žiadny. Ako často dochádza k takémuto javu? Koľko percent buniek (zhlukov) musí byť z tohoto dôvodu zahodených? K čomu slúžia permutácie osí pri vizualizácii?
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena