Prostorové uspořádání molekul proteinů

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Milan Chmelař, CSc. (místopředseda) Ing. Pavel Leinveber (člen) prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorVítková, Helenacs
dc.contributor.authorNovotný, Jancs
dc.contributor.refereeMaděránková, Denisacs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractCílem této práce bylo seznámit se s prostorovým uspořádáním molekul proteinů, s jejich získáváním, způsoby zápisu a veličinami sloužícími k jejich popisu. Predikce proteinových struktur je velice důležitá pro zjištění funkce budoucích proteinů. Dalším cílem bylo vytvoření funkce v prostředí MATLAB, která bude graficky reprezentovat prostorové uspořádání páteřní struktury proteinu formou Ramachandranova diagramu. Společně s touto funkcí vytvořit další funkci k vykreslení postraních řetězců aminokyselin a funkci k výpočtu stereochemické kvality. Nakonec vytvořit program pro kompletní vyhodnocení prostorového uspořádání molekuly proteinu a výpočtu stereochemické kvality a otestování programu na proteinových strukturách z veřejné databáze RSCB PDB.cs
dc.description.abstractObjective of this work was to study the spatial arrangement of protein molecules, with their extraction, notations and variables used in the course descriptions. Prediction of protein structures is very important for determining the future function of proteins. Another objective was to create a function in MATLAB that will graphically represent the spatial arrangement of the backbone structure of the protein by form Ramachandran plot. Along with this function create another function to render the side-chains of amino acids and function to calculate the stereochemical quality. Finally, create a program for a complete assessment of the spatial arrangement of the protein molecules and calculating the stereochemical quality of and test program for protein structures from public databases RSCB PDB.en
dc.description.markDcs
dc.identifier.citationNOVOTNÝ, J. Prostorové uspořádání molekul proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other65411cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/26170
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectProteincs
dc.subjectPDBcs
dc.subjectAlfa helixcs
dc.subjectBeta listcs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectRTGcs
dc.subjectkrystalografiecs
dc.subjectNMRcs
dc.subjectspektroskopiecs
dc.subjectRamachandranův diagramcs
dc.subjecttorzní úhlycs
dc.subjectvazebné úhlycs
dc.subjectpolypeptidový řetězeccs
dc.subjectProtheinen
dc.subjectPDBen
dc.subjectAlfa helixen
dc.subjectBeta sheeten
dc.subjectDNAen
dc.subjectRTGen
dc.subjectkrystalodraphyen
dc.subjectNMRen
dc.subjectspectroscopyen
dc.subjectRamachandran ploten
dc.subjecttorsion anglesen
dc.subjectbond anglesen
dc.subjectpolypeptide chainen
dc.titleProstorové uspořádání molekul proteinůcs
dc.title.alternativeGeometry of protein moleculsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-20cs
dcterms.modified2013-06-24-09:48:26cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid65411en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:24:55en
sync.item.modts2025.01.17 13:27:10en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.11 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
1.88 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_65411.html
Size:
5.21 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_65411.html
Download
Collections
2013