Porovnání a převod databází signálních drah
| but.committee | cs | |
| but.defence | cs | |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Smrž, Pavel | cs |
| dc.contributor.author | Němeček, Pavel | cs |
| dc.contributor.referee | Šilhavá, Jana | cs |
| dc.date.accessioned | 2019-04-03T22:45:33Z | |
| dc.date.available | 2019-04-03T22:45:33Z | |
| dc.date.created | 2008 | cs |
| dc.description.abstract | Tato práce se zabývá porovnáním a převodem databází signálních drah. Značná část je věnována databázím KEGG a BioCarta. V práci jsou rozebrány formáty poskytovaných dat. Při hledání překryvů drah mezi databázemi zkouším aplikovat shlukování, srovnání editační vzdálenosti názvů, porovnání genů podle čísla NCBI a nalezení ekvivalentních vazeb. Aplikace je implementována v jazyce C++ s použitím XML parseru. Výsledky jsou prezentovány ve formě textových výstupů, případně ve formě grafů zapsaných v jazyce DOT pro zpracování programem GraphViz. | cs |
| dc.description.abstract | The main topic of this work are comparison and transformations of pathway databases. Large part is dedicated to databases KEGG and BioCarta. In work are described formats of provided data. In process of searching for overlapping pathways between databases are used clustering, edit distance, NCBI gene numbers and equivalent relationships comparison. The system was written in C++ and using XML parser. Results are text outputs, eventually files in DOT language, which can be executed with GraphViz to generate graphs. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | NĚMEČEK, P. Porovnání a převod databází signálních drah [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2008. | cs |
| dc.identifier.other | 25417 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/55420 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Signální dráha | cs |
| dc.subject | databáze KEGG | cs |
| dc.subject | KGML | cs |
| dc.subject | databáze BioCarta | cs |
| dc.subject | PID (Pathway Interaction Database) | cs |
| dc.subject | Graphviz | cs |
| dc.subject | Levenshteinova vzdálenost | cs |
| dc.subject | NCI (National Cancer Institute) | cs |
| dc.subject | NCBI (National Center for Biotechnology Information) | cs |
| dc.subject | Signaling pathway | en |
| dc.subject | database KEGG | en |
| dc.subject | KGML | en |
| dc.subject | database BioCarta | en |
| dc.subject | PID (Pathway Interaction Database) | en |
| dc.subject | Graphviz | en |
| dc.subject | Levenshtein distance | en |
| dc.subject | NCI (National Cancer Institute) | en |
| dc.subject | NCBI (National Center for Biotechnology Information) | en |
| dc.title | Porovnání a převod databází signálních drah | cs |
| dc.title.alternative | Comparison and Transformations of Pathway Databases | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2008-06-12 | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-09-23:40:56 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 25417 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2020.05.10 02:10:35 | en |
| sync.item.modts | 2020.05.10 00:59:05 | en |
| thesis.discipline | Informační technologie | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačové grafiky a multimédií | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |