Pokročilé zarovnávání a určování genetické odlišnosti sekvencí DNA

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jiří Rozman, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. (člen) prof. MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen) MUDr. Lenka Forýtková, CSc. (člen)cs
but.defenceStudent obhájil bakalářskou práci.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorValla, Martincs
dc.contributor.authorTrněný, Ondřejcs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2011cs
dc.description.abstractBiologické sekvence se neustále vyvíjejí, dochází u nich k mutacím, delecím a inzercím. Z důvodu potřeby klasifikovat sekvence a stanovit míru jejich podobnosti byly vytvořeny metody pro jejich zarovnání jako jsou bodová matice nebo algoritmy Needleman-Wunsch a Smith-Waterman pro globální a lokální zarovnání. Tyto konzervativní metody jsou však omezeny na předpoklad, že přestože došlo v sekvencích ke změnám, zachovaly si malou vzdálenost mezi podobnými úseky. Proto byly vytvořeny metody pro porovnání bez zarovnání, jako je metoda znaků v sekvenci, Euklidovská vzdálenost nebo Univerzální sekvenční mapy, které se snaží nedostatky metod využívajících zarovnání eliminovat.cs
dc.description.abstractBiological sequences are constantly evolving so there are mutations, deletions and inserts. Because of need to classify these sequences and determine degree of their similarity have been developed aligment methods. For example Dot matrix or algorithms like Needleman-Wunsch and Smith-Waterman used for global and local alignment. These methods can be considered as conservative and are limited because it is assumed that although there have been changes during evolution they still preserve small distance between similar regions. Therefore number of methods have been proposed to eliminate these limitations by comparing sequences without alignment. These methods for example Words in sequences, Euklidean distance or Universal sequence maps are designed to eliminate limitations of alignment using methods.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationTRNĚNÝ, O. Pokročilé zarovnávání a určování genetické odlišnosti sekvencí DNA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.cs
dc.identifier.other39584cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/1943
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMatlabcs
dc.subjectrozšířené globální zarovnánícs
dc.subjectglobální zarovnánícs
dc.subjectlokální zarovnánícs
dc.subjectNeedleman-Wunschcs
dc.subjectSmith-Watermancs
dc.subjectBLOSUMcs
dc.subjectPAMcs
dc.subjectMatlaben
dc.subjectgeneralized global alignmenten
dc.subjectglobal alignmenten
dc.subjectlocal alignmenten
dc.subjectNeedleman-Wunschen
dc.subjectSmith-Watermanen
dc.subjectBLOSUMen
dc.subjectPAMen
dc.titlePokročilé zarovnávání a určování genetické odlišnosti sekvencí DNAcs
dc.title.alternativeDetermination genetics differencies using alignment signal of biological sequences DNAen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2011-06-16cs
dcterms.modified2011-07-15-10:45:45cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid39584en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:17:38en
sync.item.modts2025.01.15 16:10:11en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.8 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
368.81 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_39584.html
Size:
6.32 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_39584.html
Download
Collections
2011