Metody predikce sekundární struktury proteinů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka odpověděla na otázky oponenta a členů komise. doc. Kolář: Co znamená, že metoda je statistická? Studentka obhájila bakalářskou práci.cs
but.jazykslovenština (Slovak)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisask
dc.contributor.authorHoštáková, Ninask
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnask
dc.date.created2012cs
dc.description.abstractZkoumání proteinových struktur má klíčový význam při zjišťování způsobů působení bílkovin v organizmu. Práce zpracovává problematiku 1D, 2D a 3D struktur, do kterých se proteiny v prostoru uspořádavají. Důraz je kladen na sekundární strukturu, kterou lze predikovat přímo ze sekvencí aminokyselin a následně ji využít pro odhad prostorové struktury. Tomuto postupu se věnují výpočetní metody, které pomocí algoritmů konvertují sled aminokyselin na sled sekundárních struktur. Přímým určením struktury, pomocí vytváření strukturních modelů, se zabývá část věnovaná experimentálním metodám (NMR spektroskopiie, RTG krystalografie). Hlavním cílem práce je programová realizace metody predikující sekundární strukturu proteinů. Vytvořený program je doplněn o grafické uživatelské rozhraní. Výsledky programu, navrženého na základě metody Chou-Fasman, jsou v závěrečné části práce porovnány s výstupy volně dostupných softwarů z internetu.sk
dc.description.abstractThe examination of protein structure is crucial in determining protein function in organism. This work deals with the issue of 1D, 2D and 3D structures, into which are proteins organized in space. Emphasis is placed on secondary structure, which can be predicted directly from the amino acid sequences and then used for the estimation of spatial structure. On this procedure are focused computational methods, using algorithms that convert the order of amino acids into the order of preferences for secondary structures. To direct determination of the structure by creating structural models is devoted chapter Experimental Methods (NMR spectroscopy, RTG crystallography). The main aim of this work is practical realization of protein secondary structure prediction method. The created program is supplemented by graphical user interface. In the final part the results of the program based on Chou- Fasman method are compared to the outputs of freely available softwares from the Internet.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationHOŠTÁKOVÁ, N. Metody predikce sekundární struktury proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2012.cs
dc.identifier.other51795cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/12442
dc.language.isoskcs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectproteinysk
dc.subjectsekundární strukturask
dc.subjectpredikcesk
dc.subjectRTG krystalografiesk
dc.subjectNMR spektroskopiesk
dc.subjectvýpočetní metodysk
dc.subjectChou-Fasmanova metodask
dc.subjectproteinsen
dc.subjectsecondary structureen
dc.subjectpredictionen
dc.subjectRTG crystallographyen
dc.subjectNMR spectroscopyen
dc.subjectcomputational methodsen
dc.subjectChou-Fasman methoden
dc.titleMetody predikce sekundární struktury proteinůsk
dc.title.alternativeMethods for prediction of secondary structure in proteinsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2012-06-14cs
dcterms.modified2012-06-18-09:24:43cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid51795en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:21:54en
sync.item.modts2025.01.15 21:18:30en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.62 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
16.55 KB
Format:
Unknown data format
Description:
file appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_51795.html
Size:
4.75 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_51795.html
Download
Collections
2012