Analýza diagnostických parametrů srdce ve 4D CINE MRI datech

Abstract

Tato práce je věnována výpočtu a analýze parametrů srdeční funkce, které je možné stanovit z obrazových dat pořízených magnetickou rezonancí. Pro výpočet byly použity ručně anotované snímky pořízené v krátké srdeční ose. Objemové parametry byly dopočítány přímo z obrazových dat sečtením voxelů náležejícím k příslušným strukturám srdce a následným vynásobením objemem voxelu. Funkční parametry byly následně dopočítány dle oficiálních definic z objemových parametrů. Dále byla stanovena tloušťka stěny myokardu levé komory pomocí modifikované radiální metody a kontraktilita myokardu pomocí segmentální deformační analýzy. Výsledné hodnoty byly vyneseny do tabulky a zobrazeny box–ploty. Dále byla provedena korelační analýza a následná zkouška klasifikačního stromu na vypočtených datech.The thesis is focused on calculation and analysis of heart function parameters which could be calculated from image data obtained by magnetic resonance. Manually annotated image data in short axis of heart were used for calculation. Volumetric parameters were calculated directly from image data by counting voxels which were parts of specific heart structure and then multiplied by voxel volume. Modified radial method was used to compute functional parameters whereas myocardial contractility was calculated by using segmental strain analysis. Obtained results were given into table and visualised in box– plots. Correlation analysis of parameters was also performed and decision tree classifier was used to test discrimination capacity of estimated parameters.